More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7258 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  100 
 
 		 1056 aa  2011    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  54.11 
 
 		 1036 aa  857    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  52.05 
 
 		 1110 aa  850    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  45.46 
 
 		 1087 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 1100 aa  629  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  41.61 
 
 		 1042 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  43.82 
 
 		 1072 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  41.76 
 
 		 1066 aa  597  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  41.65 
 
 		 1050 aa  585  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  42.63 
 
 		 1093 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  42.66 
 
 		 1058 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  40.13 
 
 		 1097 aa  551  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  41.96 
 
 		 1048 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 1058 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  40.14 
 
 		 1125 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  38.03 
 
 		 1049 aa  527  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  39.78 
 
 		 1102 aa  522  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  40.64 
 
 		 1092 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  40.11 
 
 		 1103 aa  513  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  40.88 
 
 		 1060 aa  500  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 1043 aa  485  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  41.37 
 
 		 1028 aa  466  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 1082 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  48.92 
 
 		 1055 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  37.44 
 
 		 1017 aa  466  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  39.42 
 
 		 1094 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  42.9 
 
 		 960 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 957 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  45.16 
 
 		 922 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  47.21 
 
 		 1005 aa  402  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  42.17 
 
 		 952 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 1158 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  51.97 
 
 		 1186 aa  344  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  40.21 
 
 		 943 aa  340  7e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 1005 aa  340  7e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 969 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  38.56 
 
 		 1227 aa  323  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  34.5 
 
 		 1018 aa  319  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.6 
 
 		 999 aa  318  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  35.76 
 
 		 1064 aa  311  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  39.11 
 
 		 792 aa  310  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 781 aa  299  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  35.04 
 
 		 1085 aa  297  9e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 		 886 aa  289  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  35.96 
 
 		 824 aa  287  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 963 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  36.3 
 
 		 1131 aa  277  9e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  39.29 
 
 		 701 aa  275  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 775 aa  275  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  35.5 
 
 		 799 aa  273  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  32.87 
 
 		 816 aa  273  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  46.82 
 
 		 840 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  39.45 
 
 		 980 aa  265  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 941 aa  265  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  35.22 
 
 		 943 aa  259  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  43.26 
 
 		 1119 aa  258  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  41.47 
 
 		 916 aa  258  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  41.2 
 
 		 760 aa  257  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  36.91 
 
 		 1076 aa  253  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  42.89 
 
 		 887 aa  249  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 1085 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 882 aa  245  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 972 aa  244  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 1034 aa  244  9e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  39.91 
 
 		 827 aa  243  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  47.54 
 
 		 591 aa  243  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 814 aa  239  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  45.79 
 
 		 591 aa  239  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  43.09 
 
 		 755 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  36.51 
 
 		 1049 aa  235  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 901 aa  234  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  40.9 
 
 		 765 aa  231  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 950 aa  231  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  38.96 
 
 		 776 aa  231  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 961 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  38.78 
 
 		 921 aa  230  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 818 aa  228  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  36.4 
 
 		 966 aa  228  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  44.33 
 
 		 919 aa  227  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  37.52 
 
 		 1161 aa  226  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  41.43 
 
 		 780 aa  226  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 1100 aa  225  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  41.87 
 
 		 1000 aa  222  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 877 aa  221  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 630 aa  220  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  42.82 
 
 		 601 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  36.22 
 
 		 777 aa  219  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  43.17 
 
 		 658 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  38.58 
 
 		 779 aa  218  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01160  predicted ATPase  34.12 
 
 		 892 aa  218  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 922 aa  216  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  41.95 
 
 		 1001 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 953 aa  216  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  33.77 
 
 		 996 aa  216  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  41.26 
 
 		 973 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  41.64 
 
 		 973 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.07 
 
 		 950 aa  215  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 393 aa  214  7.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  37.75 
 
 		 678 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  34.43 
 
 		 1060 aa  213  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>