More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1385 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 1186 aa  2329    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  51.69 
 
 		 1100 aa  581  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  51.73 
 
 		 1093 aa  372  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  48.73 
 
 		 1042 aa  342  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 1058 aa  335  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  51.73 
 
 		 1056 aa  333  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  52.91 
 
 		 1072 aa  326  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  51.14 
 
 		 1087 aa  326  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  52.59 
 
 		 1036 aa  323  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  48.19 
 
 		 1050 aa  319  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 		 1066 aa  318  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  48 
 
 		 1110 aa  316  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  47.61 
 
 		 1043 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 1058 aa  310  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 1082 aa  310  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  45.68 
 
 		 1097 aa  304  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  44.27 
 
 		 957 aa  296  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  47.87 
 
 		 1048 aa  295  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  46.05 
 
 		 960 aa  283  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  43.64 
 
 		 1017 aa  283  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  34.16 
 
 		 1049 aa  281  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  42.45 
 
 		 1102 aa  280  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  42.27 
 
 		 1125 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  42.92 
 
 		 1092 aa  276  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 1094 aa  265  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  48.66 
 
 		 1060 aa  263  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  46.03 
 
 		 1028 aa  260  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  39.77 
 
 		 1018 aa  258  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  41.42 
 
 		 1103 aa  258  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 		 1158 aa  256  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  40.82 
 
 		 969 aa  249  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  42.51 
 
 		 1055 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  45.39 
 
 		 1005 aa  235  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  38.94 
 
 		 952 aa  233  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 943 aa  225  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  40.24 
 
 		 940 aa  224  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 1005 aa  216  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 781 aa  215  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  40.61 
 
 		 922 aa  214  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  36.92 
 
 		 934 aa  214  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  38.41 
 
 		 1000 aa  211  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 		 1227 aa  206  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  38.24 
 
 		 943 aa  205  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  37.85 
 
 		 1014 aa  203  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 1071 aa  202  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  37.28 
 
 		 1010 aa  202  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  34.31 
 
 		 824 aa  201  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  35.84 
 
 		 1003 aa  197  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  38.52 
 
 		 963 aa  196  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  37.37 
 
 		 995 aa  196  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  39.04 
 
 		 1123 aa  195  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  34.7 
 
 		 621 aa  194  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  34.95 
 
 		 792 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  37.36 
 
 		 990 aa  194  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  39.5 
 
 		 701 aa  192  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  40 
 
 		 1733 aa  190  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  38.28 
 
 		 941 aa  188  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  36.9 
 
 		 989 aa  187  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 775 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  34.81 
 
 		 990 aa  186  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  37.29 
 
 		 1088 aa  184  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.49 
 
 		 981 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  35.7 
 
 		 931 aa  182  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  40.26 
 
 		 378 aa  181  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.47 
 
 		 983 aa  180  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1022 aa  181  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  35.83 
 
 		 999 aa  180  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  31.47 
 
 		 799 aa  180  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  35.53 
 
 		 1025 aa  179  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  34.59 
 
 		 996 aa  179  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  39.21 
 
 		 370 aa  178  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  36.13 
 
 		 1030 aa  178  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  43.84 
 
 		 1119 aa  178  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  39.35 
 
 		 1001 aa  178  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  34.39 
 
 		 1085 aa  177  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.31 
 
 		 631 aa  177  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.86 
 
 		 496 aa  177  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  33.63 
 
 		 964 aa  177  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 654 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  35.55 
 
 		 1033 aa  176  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.89 
 
 		 950 aa  174  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.02 
 
 		 921 aa  174  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 814 aa  173  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 1048 aa  173  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.72 
 
 		 1108 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  38.94 
 
 		 780 aa  169  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  42.28 
 
 		 1131 aa  170  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  40.13 
 
 		 916 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  32.2 
 
 		 1027 aa  168  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 901 aa  167  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  34.2 
 
 		 962 aa  167  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.73 
 
 		 1017 aa  167  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  34.87 
 
 		 921 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  36.9 
 
 		 907 aa  166  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  32.2 
 
 		 630 aa  165  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  32.72 
 
 		 1064 aa  165  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  34.69 
 
 		 928 aa  165  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  35.84 
 
 		 816 aa  165  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 268 aa  164  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  34.82 
 
 		 1025 aa  164  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>