More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0853 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  39.75 
 
 		 1027 aa  638    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1010 aa  2027    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  41.24 
 
 		 1014 aa  652    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  40.9 
 
 		 995 aa  645    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  39.92 
 
 		 1003 aa  622  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  41.11 
 
 		 1033 aa  611  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  39.53 
 
 		 990 aa  590  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  39.19 
 
 		 1003 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  40.45 
 
 		 1001 aa  567  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.15 
 
 		 983 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  43.53 
 
 		 1030 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  41.4 
 
 		 1088 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  41.68 
 
 		 940 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  33.62 
 
 		 934 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  41.58 
 
 		 1025 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  40.43 
 
 		 1022 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  38.9 
 
 		 1071 aa  364  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  32.13 
 
 		 1020 aa  363  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  36.36 
 
 		 931 aa  361  4e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  32.5 
 
 		 981 aa  359  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  40.88 
 
 		 990 aa  358  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  41.26 
 
 		 921 aa  357  5e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  32.43 
 
 		 919 aa  357  6.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 1048 aa  355  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  40.27 
 
 		 930 aa  351  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  36.36 
 
 		 1108 aa  347  7e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  41.13 
 
 		 1003 aa  339  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  30.32 
 
 		 1017 aa  337  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  37.16 
 
 		 907 aa  330  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 654 aa  326  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  32.56 
 
 		 946 aa  323  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  35.8 
 
 		 1011 aa  320  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  37.19 
 
 		 1054 aa  318  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  32.52 
 
 		 992 aa  317  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  32.94 
 
 		 1008 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.94 
 
 		 921 aa  311  5e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  31.45 
 
 		 996 aa  306  9.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  36.9 
 
 		 956 aa  306  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  36.16 
 
 		 992 aa  306  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  39.28 
 
 		 941 aa  306  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  37.61 
 
 		 928 aa  304  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  39.3 
 
 		 950 aa  304  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  37.21 
 
 		 913 aa  303  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 		 970 aa  301  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  32.49 
 
 		 954 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  38.21 
 
 		 1025 aa  301  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  31.36 
 
 		 908 aa  301  6e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  36.53 
 
 		 1022 aa  298  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  39.61 
 
 		 1138 aa  297  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  36.97 
 
 		 1034 aa  295  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  36.17 
 
 		 621 aa  293  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  36.07 
 
 		 964 aa  290  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  36.53 
 
 		 928 aa  290  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  34.78 
 
 		 993 aa  290  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  38.79 
 
 		 935 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  35.15 
 
 		 967 aa  285  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  39.67 
 
 		 496 aa  282  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  36.11 
 
 		 965 aa  278  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  32.61 
 
 		 965 aa  278  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  45.94 
 
 		 915 aa  277  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 1319 aa  275  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  34.06 
 
 		 982 aa  275  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  35.44 
 
 		 1030 aa  274  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  37.3 
 
 		 963 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  36.5 
 
 		 612 aa  269  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  30.79 
 
 		 1013 aa  267  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  35.42 
 
 		 775 aa  267  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  35.45 
 
 		 962 aa  265  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  38.22 
 
 		 910 aa  263  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  38.63 
 
 		 582 aa  261  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.45 
 
 		 989 aa  258  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  32.43 
 
 		 1021 aa  258  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 1346 aa  257  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  38.03 
 
 		 910 aa  254  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  40.28 
 
 		 453 aa  253  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  36.99 
 
 		 937 aa  251  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  31.52 
 
 		 971 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  36.45 
 
 		 926 aa  249  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  39 
 
 		 1024 aa  247  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  32.53 
 
 		 981 aa  246  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 621 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  42.34 
 
 		 788 aa  237  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  36.42 
 
 		 915 aa  236  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  41.6 
 
 		 850 aa  234  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  40 
 
 		 790 aa  230  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.33 
 
 		 631 aa  226  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  43.98 
 
 		 993 aa  224  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  43.5 
 
 		 715 aa  223  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  31.72 
 
 		 797 aa  221  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  37.8 
 
 		 994 aa  221  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  39.12 
 
 		 806 aa  220  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  41.71 
 
 		 814 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  34.97 
 
 		 978 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 622 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  35.12 
 
 		 666 aa  212  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  32.95 
 
 		 632 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  40.12 
 
 		 757 aa  209  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  41.39 
 
 		 1004 aa  207  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  32.9 
 
 		 957 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  37.63 
 
 		 838 aa  197  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>