More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2036 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  100 
 
 		 1110 aa  2118    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  52 
 
 		 1056 aa  873    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  49.73 
 
 		 1036 aa  760    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  44.27 
 
 		 1087 aa  619  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  41.08 
 
 		 1100 aa  590  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  41.22 
 
 		 1050 aa  578  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 1097 aa  579  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  39.58 
 
 		 1042 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  43.54 
 
 		 1058 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 1058 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 		 1066 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  37.31 
 
 		 1049 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  39.19 
 
 		 1125 aa  499  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  43.21 
 
 		 1072 aa  495  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  39.22 
 
 		 1048 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  39.88 
 
 		 1017 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.7 
 
 		 1102 aa  469  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  37.2 
 
 		 1092 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  38.49 
 
 		 1103 aa  459  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  36.86 
 
 		 1043 aa  452  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  42.45 
 
 		 1093 aa  452  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  38.01 
 
 		 1060 aa  445  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 1082 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  42.81 
 
 		 1094 aa  423  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  44.11 
 
 		 957 aa  419  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  37.46 
 
 		 1028 aa  419  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  40.92 
 
 		 1055 aa  419  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  43.76 
 
 		 1158 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  38.25 
 
 		 922 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  42.33 
 
 		 960 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 1005 aa  340  5.9999999999999996e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 952 aa  337  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  41.86 
 
 		 1005 aa  338  5e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  41.73 
 
 		 969 aa  336  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  39.53 
 
 		 943 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  33.8 
 
 		 1018 aa  314  4.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 1186 aa  294  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  38.55 
 
 		 824 aa  288  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  32.63 
 
 		 1131 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  36.04 
 
 		 1064 aa  281  6e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  35.98 
 
 		 1227 aa  278  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 781 aa  269  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  43.52 
 
 		 1085 aa  269  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 775 aa  267  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  36.55 
 
 		 941 aa  263  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 963 aa  259  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  32.47 
 
 		 1076 aa  257  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  38.29 
 
 		 886 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  37.02 
 
 		 1027 aa  254  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 1137 aa  252  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  35.06 
 
 		 792 aa  251  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  34.34 
 
 		 1119 aa  249  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.9 
 
 		 999 aa  249  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 1060 aa  248  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 943 aa  246  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  35.76 
 
 		 1049 aa  246  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  38.8 
 
 		 980 aa  245  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 1034 aa  244  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  42.63 
 
 		 972 aa  240  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  40.05 
 
 		 887 aa  239  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.47 
 
 		 816 aa  239  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 882 aa  235  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  35.2 
 
 		 1100 aa  234  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  32.97 
 
 		 799 aa  229  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  42.33 
 
 		 916 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  44.22 
 
 		 840 aa  225  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  40.57 
 
 		 760 aa  224  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 814 aa  224  7e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  37.35 
 
 		 701 aa  223  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  39.95 
 
 		 765 aa  222  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  34.84 
 
 		 630 aa  221  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  40.63 
 
 		 1085 aa  220  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 1079 aa  220  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  36.88 
 
 		 950 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  34.36 
 
 		 630 aa  209  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  37.47 
 
 		 827 aa  208  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  33.4 
 
 		 901 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  31.79 
 
 		 1056 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  39.35 
 
 		 678 aa  206  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  40.95 
 
 		 779 aa  206  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  36.18 
 
 		 950 aa  204  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  31.78 
 
 		 777 aa  204  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  37.22 
 
 		 621 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  35.31 
 
 		 966 aa  202  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  41.36 
 
 		 755 aa  202  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  35.17 
 
 		 921 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  38.66 
 
 		 928 aa  201  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  33.12 
 
 		 768 aa  201  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  40.05 
 
 		 776 aa  199  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  44.61 
 
 		 919 aa  198  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  40.7 
 
 		 1141 aa  197  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  37.67 
 
 		 1001 aa  195  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  34 
 
 		 922 aa  195  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  36.07 
 
 		 780 aa  194  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  33.57 
 
 		 1044 aa  194  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  33.24 
 
 		 990 aa  194  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 953 aa  194  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 393 aa  193  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  39.9 
 
 		 973 aa  193  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 888 aa  193  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>