More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3099 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 654 aa  1285    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  39.97 
 
 		 1022 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  42.45 
 
 		 971 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  43.21 
 
 		 950 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  37.77 
 
 		 1108 aa  379  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  39.78 
 
 		 992 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  40.13 
 
 		 1025 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  40.52 
 
 		 990 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  41.97 
 
 		 1021 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  40.2 
 
 		 954 aa  347  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  39.19 
 
 		 1003 aa  346  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  39.12 
 
 		 934 aa  342  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  37.69 
 
 		 621 aa  332  9e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  38.78 
 
 		 981 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  37.36 
 
 		 612 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  38.11 
 
 		 775 aa  327  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  39.17 
 
 		 931 aa  324  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  37.56 
 
 		 1010 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  37.48 
 
 		 1014 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  37.42 
 
 		 1003 aa  312  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  37.3 
 
 		 1030 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  37.11 
 
 		 990 aa  311  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  38.85 
 
 		 632 aa  310  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  37.44 
 
 		 1022 aa  309  9e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  37.94 
 
 		 940 aa  309  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  37.87 
 
 		 992 aa  308  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  39.57 
 
 		 1138 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  35.5 
 
 		 993 aa  304  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  36.58 
 
 		 1020 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  37.54 
 
 		 941 aa  297  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  40.23 
 
 		 965 aa  296  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  42.09 
 
 		 453 aa  292  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  37.85 
 
 		 1088 aa  287  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  40.75 
 
 		 1024 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  34.21 
 
 		 1017 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  35.44 
 
 		 983 aa  282  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  36.89 
 
 		 1025 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  37.28 
 
 		 935 aa  279  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  34.24 
 
 		 996 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  34.66 
 
 		 995 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  35.45 
 
 		 964 aa  276  9e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  35.43 
 
 		 963 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 1319 aa  272  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  34.58 
 
 		 930 aa  272  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  34.95 
 
 		 666 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  35.13 
 
 		 946 aa  270  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 1048 aa  267  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 1071 aa  266  7e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  34.2 
 
 		 913 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  34.87 
 
 		 1033 aa  263  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  33.06 
 
 		 1027 aa  263  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.94 
 
 		 496 aa  259  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.22 
 
 		 921 aa  259  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  35.35 
 
 		 1003 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  34.59 
 
 		 970 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  38.81 
 
 		 910 aa  255  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 622 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  32.11 
 
 		 907 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  36.61 
 
 		 582 aa  250  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  34.21 
 
 		 921 aa  249  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  35.4 
 
 		 1013 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 1346 aa  248  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  34.34 
 
 		 1034 aa  247  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  37.06 
 
 		 994 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  34.87 
 
 		 1008 aa  241  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  38.75 
 
 		 1001 aa  240  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  34.26 
 
 		 981 aa  240  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  36.78 
 
 		 962 aa  236  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  34.35 
 
 		 919 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.69 
 
 		 631 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  33.94 
 
 		 1030 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  35.27 
 
 		 910 aa  234  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  34.15 
 
 		 956 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  31.76 
 
 		 1011 aa  232  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  34.55 
 
 		 989 aa  230  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  37.54 
 
 		 926 aa  226  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 621 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  32.28 
 
 		 957 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  34.19 
 
 		 928 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  35.24 
 
 		 915 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  34.58 
 
 		 908 aa  216  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  34.15 
 
 		 965 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  31.94 
 
 		 982 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  34.38 
 
 		 1054 aa  214  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  34.97 
 
 		 928 aa  213  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  31.33 
 
 		 993 aa  207  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  32.61 
 
 		 978 aa  206  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  42.53 
 
 		 761 aa  204  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  32.57 
 
 		 937 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  29.97 
 
 		 967 aa  197  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  39.71 
 
 		 370 aa  196  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  34.77 
 
 		 1102 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  37.69 
 
 		 806 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  44 
 
 		 1733 aa  180  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  34.2 
 
 		 1058 aa  180  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  34.89 
 
 		 1017 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  31.81 
 
 		 1060 aa  179  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  29.92 
 
 		 952 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.04 
 
 		 1092 aa  177  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 602 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>