More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5677 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 965 aa  1861    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  40.23 
 
 		 931 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  37.22 
 
 		 1020 aa  426  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  36.89 
 
 		 1003 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  37.03 
 
 		 1054 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  34.74 
 
 		 1022 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  34.82 
 
 		 993 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  40.46 
 
 		 1088 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  31.98 
 
 		 1027 aa  389  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  36.6 
 
 		 940 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.61 
 
 		 981 aa  382  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  34.18 
 
 		 996 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.56 
 
 		 921 aa  368  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  34.8 
 
 		 970 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 1048 aa  360  6e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  34.38 
 
 		 921 aa  357  5e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  33.91 
 
 		 930 aa  355  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  37.01 
 
 		 950 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  34.93 
 
 		 956 aa  351  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  33.02 
 
 		 946 aa  350  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  33.73 
 
 		 919 aa  350  9e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  35.16 
 
 		 1025 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  34.17 
 
 		 941 aa  349  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  35.23 
 
 		 1003 aa  348  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  41.3 
 
 		 990 aa  348  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  34.76 
 
 		 928 aa  345  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  34.64 
 
 		 928 aa  345  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  34.86 
 
 		 1014 aa  345  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  33.6 
 
 		 992 aa  344  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 1071 aa  338  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 654 aa  335  4e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  34.92 
 
 		 965 aa  334  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  34.75 
 
 		 1022 aa  334  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  34 
 
 		 1011 aa  333  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  38.93 
 
 		 995 aa  330  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  35.61 
 
 		 1033 aa  329  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  33.3 
 
 		 934 aa  329  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  35.1 
 
 		 993 aa  328  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  32.44 
 
 		 1017 aa  325  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  33.66 
 
 		 967 aa  325  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  33.64 
 
 		 992 aa  324  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  38.17 
 
 		 1030 aa  323  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  34.2 
 
 		 1108 aa  322  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  32.77 
 
 		 1010 aa  319  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  36.06 
 
 		 1025 aa  317  5e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  32.46 
 
 		 983 aa  317  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  32.12 
 
 		 907 aa  307  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  34.23 
 
 		 1138 aa  307  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  32.59 
 
 		 962 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  33.3 
 
 		 990 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  38.83 
 
 		 621 aa  303  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  35.67 
 
 		 954 aa  301  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  33.16 
 
 		 937 aa  301  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  37.28 
 
 		 989 aa  301  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  38.86 
 
 		 1004 aa  301  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  34.66 
 
 		 964 aa  300  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  34.04 
 
 		 978 aa  288  4e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  33.3 
 
 		 1021 aa  288  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  36.88 
 
 		 910 aa  286  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  32.57 
 
 		 1034 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  30.17 
 
 		 913 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  37.1 
 
 		 788 aa  286  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  34.31 
 
 		 1001 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  30.75 
 
 		 981 aa  281  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  32.62 
 
 		 971 aa  280  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  32.97 
 
 		 1013 aa  280  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  32.81 
 
 		 1003 aa  278  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  40.7 
 
 		 496 aa  277  9e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  33.67 
 
 		 797 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  31.97 
 
 		 908 aa  274  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  36.07 
 
 		 775 aa  271  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  34.89 
 
 		 850 aa  268  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  31.91 
 
 		 982 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  33.83 
 
 		 963 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  33.81 
 
 		 935 aa  263  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  39.19 
 
 		 790 aa  262  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  33.04 
 
 		 910 aa  262  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  44.79 
 
 		 1024 aa  260  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  33.04 
 
 		 1008 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  35.25 
 
 		 926 aa  258  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 		 755 aa  254  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  32.94 
 
 		 806 aa  253  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  33.42 
 
 		 1030 aa  248  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  36.6 
 
 		 915 aa  248  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  34.58 
 
 		 838 aa  248  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  38.44 
 
 		 582 aa  243  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  32.92 
 
 		 814 aa  240  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  33.33 
 
 		 715 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  39.49 
 
 		 453 aa  238  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  34.87 
 
 		 915 aa  236  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 621 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.8 
 
 		 742 aa  232  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 622 aa  231  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  32.08 
 
 		 741 aa  227  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.44 
 
 		 631 aa  226  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  36.18 
 
 		 632 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  37.35 
 
 		 994 aa  222  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.02 
 
 		 969 aa  221  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  32.17 
 
 		 770 aa  214  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  49.39 
 
 		 1339 aa  214  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>