More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2956 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  100 
 
 		 1339 aa  2459    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  42.38 
 
 		 1146 aa  446  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  37.03 
 
 		 1151 aa  358  3.9999999999999996e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  56.47 
 
 		 668 aa  223  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  49.4 
 
 		 965 aa  212  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  50.61 
 
 		 1003 aa  201  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  47.58 
 
 		 990 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 268 aa  180  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 786 aa  180  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  42.26 
 
 		 1000 aa  168  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  42.75 
 
 		 1123 aa  168  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  43.31 
 
 		 496 aa  165  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.66 
 
 		 950 aa  165  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  45.16 
 
 		 655 aa  164  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  38.55 
 
 		 1022 aa  163  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  42.8 
 
 		 1118 aa  162  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  38.87 
 
 		 981 aa  160  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  40.32 
 
 		 981 aa  159  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  39.93 
 
 		 1090 aa  158  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  43.01 
 
 		 957 aa  158  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 654 aa  157  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  42.46 
 
 		 1102 aa  155  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  44.18 
 
 		 1025 aa  155  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  45.21 
 
 		 1088 aa  155  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  41.46 
 
 		 1123 aa  154  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  45.02 
 
 		 676 aa  154  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  43.2 
 
 		 978 aa  153  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 		 453 aa  152  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  42.79 
 
 		 1733 aa  152  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  38.82 
 
 		 378 aa  152  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  40.65 
 
 		 1003 aa  152  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  43.43 
 
 		 1043 aa  152  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  40.56 
 
 		 1058 aa  151  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  44.08 
 
 		 1036 aa  151  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  42.45 
 
 		 1030 aa  149  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  41.03 
 
 		 940 aa  149  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 969 aa  148  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  42.45 
 
 		 1114 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 1005 aa  146  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  43.55 
 
 		 1048 aa  144  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  42.8 
 
 		 1058 aa  144  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  38.68 
 
 		 278 aa  144  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  42.56 
 
 		 489 aa  144  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  38.75 
 
 		 1013 aa  143  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  40.89 
 
 		 1092 aa  143  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  37.59 
 
 		 952 aa  143  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  39.29 
 
 		 1108 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  37.25 
 
 		 621 aa  143  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  39.77 
 
 		 262 aa  142  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  36.36 
 
 		 1020 aa  142  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  39.27 
 
 		 1010 aa  140  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  39.02 
 
 		 995 aa  141  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  43.4 
 
 		 1132 aa  140  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  41.46 
 
 		 611 aa  140  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  37.04 
 
 		 955 aa  140  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  40.98 
 
 		 1121 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  40.14 
 
 		 946 aa  139  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 1100 aa  139  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  40.65 
 
 		 1033 aa  139  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 921 aa  139  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  42.11 
 
 		 1055 aa  139  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  39.13 
 
 		 261 aa  138  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  41.25 
 
 		 931 aa  137  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 622 aa  137  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  42.91 
 
 		 963 aa  137  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  37.64 
 
 		 1054 aa  137  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  40.65 
 
 		 935 aa  137  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 1071 aa  136  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  37.31 
 
 		 907 aa  135  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  42.91 
 
 		 1097 aa  134  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  38.46 
 
 		 1017 aa  134  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  35.89 
 
 		 934 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  35.38 
 
 		 992 aa  132  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  38.87 
 
 		 1125 aa  132  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  40.24 
 
 		 1042 aa  132  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  40.16 
 
 		 1025 aa  132  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  36.18 
 
 		 535 aa  132  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  37.25 
 
 		 1017 aa  131  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  39.6 
 
 		 963 aa  131  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  45 
 
 		 1138 aa  131  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  37.05 
 
 		 1030 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  37.55 
 
 		 996 aa  130  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  41.53 
 
 		 960 aa  130  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  39.57 
 
 		 990 aa  130  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 		 1027 aa  130  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  35.77 
 
 		 1014 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  39.05 
 
 		 1021 aa  129  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  41.06 
 
 		 1093 aa  129  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  38.06 
 
 		 993 aa  128  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  40.73 
 
 		 1066 aa  128  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  39.76 
 
 		 1158 aa  127  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  44.62 
 
 		 1036 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 282 aa  127  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  39.2 
 
 		 833 aa  126  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  35.86 
 
 		 1004 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.53 
 
 		 631 aa  127  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  35.2 
 
 		 267 aa  126  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  43.04 
 
 		 1056 aa  127  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3399  transcriptional regulator, SARP family  38.15 
 
 		 647 aa  127  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00991696  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  36.78 
 
 		 983 aa  127  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>