More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2954 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  100 
 
 		 1146 aa  2160    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 1151 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  43.15 
 
 		 1339 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  40.33 
 
 		 668 aa  327  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 786 aa  324  7e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  32.62 
 
 		 1123 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  31.1 
 
 		 1090 aa  192  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  36.61 
 
 		 965 aa  189  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  34.06 
 
 		 1121 aa  188  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  33.82 
 
 		 1118 aa  187  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  34.52 
 
 		 1123 aa  185  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  31.22 
 
 		 1148 aa  181  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 1141 aa  179  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 1118 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  33.08 
 
 		 1132 aa  171  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  30.56 
 
 		 1114 aa  170  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  32.4 
 
 		 1036 aa  170  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  37.01 
 
 		 1030 aa  167  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 		 969 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  37.68 
 
 		 1003 aa  164  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 723 aa  162  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 1161 aa  161  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  37.3 
 
 		 990 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  40 
 
 		 1000 aa  159  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  33.13 
 
 		 1071 aa  156  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.06 
 
 		 1150 aa  154  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  36.94 
 
 		 1020 aa  153  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  33.1 
 
 		 1153 aa  152  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  44.31 
 
 		 1025 aa  152  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  38.79 
 
 		 940 aa  149  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  34.52 
 
 		 995 aa  148  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  41.73 
 
 		 950 aa  147  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.53 
 
 		 496 aa  147  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 1043 aa  147  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  28.48 
 
 		 1014 aa  147  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  37.94 
 
 		 1003 aa  146  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 1141 aa  146  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 1141 aa  146  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 268 aa  145  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  39.76 
 
 		 1088 aa  145  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  30.59 
 
 		 983 aa  145  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  37.65 
 
 		 1092 aa  143  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 1141 aa  143  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  39.43 
 
 		 1054 aa  142  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  36.36 
 
 		 1733 aa  142  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.64 
 
 		 1022 aa  142  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.48 
 
 		 1102 aa  142  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  33.76 
 
 		 955 aa  140  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 957 aa  140  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  44.73 
 
 		 655 aa  138  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 1097 aa  137  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  38.22 
 
 		 1004 aa  137  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  39.68 
 
 		 1011 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  34.37 
 
 		 996 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 1071 aa  134  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  35.38 
 
 		 981 aa  134  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  39.12 
 
 		 1055 aa  134  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 622 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  33.23 
 
 		 981 aa  134  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  33.44 
 
 		 1010 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  40.95 
 
 		 1058 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  41.53 
 
 		 1033 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  38.29 
 
 		 1125 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  39.16 
 
 		 1048 aa  129  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 654 aa  129  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  37.04 
 
 		 941 aa  128  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  43.31 
 
 		 676 aa  129  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  32.29 
 
 		 1103 aa  128  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  44.44 
 
 		 978 aa  128  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  38.31 
 
 		 1013 aa  128  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  41.13 
 
 		 262 aa  128  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  34.91 
 
 		 1017 aa  127  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  42.55 
 
 		 489 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  34.07 
 
 		 758 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  37.77 
 
 		 775 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  40.32 
 
 		 379 aa  127  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  38.48 
 
 		 963 aa  126  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  34.47 
 
 		 934 aa  126  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  34.96 
 
 		 1108 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  35.03 
 
 		 964 aa  125  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  34.14 
 
 		 1699 aa  124  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  39.53 
 
 		 1158 aa  124  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  36.78 
 
 		 278 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  25.14 
 
 		 1027 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  30.89 
 
 		 992 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  37.26 
 
 		 1186 aa  122  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  41.7 
 
 		 611 aa  121  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  36.31 
 
 		 1093 aa  122  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  40.25 
 
 		 1036 aa  121  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  35.76 
 
 		 378 aa  121  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  36.02 
 
 		 453 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  33.07 
 
 		 992 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  32.72 
 
 		 621 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  36.14 
 
 		 388 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  42.68 
 
 		 1028 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.73 
 
 		 1100 aa  119  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3489  SARP family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148382  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.9 
 
 		 921 aa  119  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  37.54 
 
 		 1017 aa  118  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  32.17 
 
 		 1030 aa  118  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>