More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0573 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 		 1699 aa  3304    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  51.97 
 
 		 1733 aa  1504    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  31.55 
 
 		 1334 aa  374  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.26 
 
 		 1553 aa  354  5.9999999999999994e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.64 
 
 		 1481 aa  347  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  31.8 
 
 		 1344 aa  338  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.2 
 
 		 1686 aa  335  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.46 
 
 		 1711 aa  318  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.39 
 
 		 1510 aa  307  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  29.31 
 
 		 1265 aa  304  7.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  30.07 
 
 		 1357 aa  303  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1657 aa  293  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  34.61 
 
 		 901 aa  292  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.12 
 
 		 1760 aa  288  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.13 
 
 		 1236 aa  269  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29 
 
 		 1240 aa  265  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  35.51 
 
 		 885 aa  258  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.96 
 
 		 1599 aa  251  8e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  32.56 
 
 		 1230 aa  249  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.14 
 
 		 1583 aa  244  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.31 
 
 		 1598 aa  240  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.49 
 
 		 1823 aa  240  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  38.73 
 
 		 1157 aa  239  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  30.25 
 
 		 1401 aa  234  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  27.67 
 
 		 1308 aa  232  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1073 aa  216  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.95 
 
 		 1609 aa  214  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.95 
 
 		 1617 aa  211  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  28.44 
 
 		 1355 aa  206  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.73 
 
 		 1547 aa  198  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.34 
 
 		 1626 aa  196  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 		 972 aa  193  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  29.86 
 
 		 902 aa  189  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.66 
 
 		 1190 aa  187  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.4 
 
 		 1398 aa  181  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  29.85 
 
 		 1078 aa  177  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  31.65 
 
 		 1301 aa  176  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  35.07 
 
 		 1013 aa  172  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  41.41 
 
 		 940 aa  172  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  40.49 
 
 		 378 aa  169  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.28 
 
 		 1267 aa  168  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 		 973 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  26.28 
 
 		 1399 aa  167  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.37 
 
 		 1607 aa  167  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  31.48 
 
 		 1217 aa  166  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.05 
 
 		 919 aa  164  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  33.55 
 
 		 897 aa  164  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 		 1046 aa  164  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 969 aa  163  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 969 aa  162  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.68 
 
 		 924 aa  162  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  22.4 
 
 		 1363 aa  162  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 965 aa  161  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  39.45 
 
 		 1161 aa  161  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  24.1 
 
 		 1491 aa  159  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 654 aa  159  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.96 
 
 		 1163 aa  159  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  40.07 
 
 		 1000 aa  158  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 969 aa  157  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  33.98 
 
 		 1123 aa  157  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 		 1032 aa  156  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 268 aa  155  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  33.04 
 
 		 1022 aa  152  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  35.38 
 
 		 1194 aa  152  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  29.3 
 
 		 1523 aa  151  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  35.75 
 
 		 1353 aa  150  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  37.9 
 
 		 1020 aa  149  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  36.49 
 
 		 489 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  37.15 
 
 		 1093 aa  148  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1026 aa  147  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  36.43 
 
 		 388 aa  147  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.51 
 
 		 960 aa  146  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  38.89 
 
 		 965 aa  146  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.85 
 
 		 1125 aa  145  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 		 1020 aa  145  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.26 
 
 		 1256 aa  145  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  24.79 
 
 		 1211 aa  142  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.82 
 
 		 1652 aa  142  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  28.52 
 
 		 1014 aa  142  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  28.39 
 
 		 1005 aa  142  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  39.36 
 
 		 919 aa  142  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  37.98 
 
 		 950 aa  142  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  36.88 
 
 		 981 aa  142  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 		 1314 aa  141  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  36.6 
 
 		 1123 aa  140  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  36.65 
 
 		 1108 aa  141  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  24.82 
 
 		 1229 aa  140  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.36 
 
 		 1557 aa  140  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.49 
 
 		 921 aa  140  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  42.17 
 
 		 655 aa  139  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  36.51 
 
 		 621 aa  138  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 957 aa  138  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  36.5 
 
 		 1102 aa  138  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  40.48 
 
 		 935 aa  137  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7111  Serine/threonine protein kinase-like protein  27.96 
 
 		 1194 aa  138  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  38.19 
 
 		 1003 aa  137  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.03 
 
 		 1196 aa  137  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.2 
 
 		 947 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1392 aa  137  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  36.04 
 
 		 1043 aa  136  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>