More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2669 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  73.2 
 
 		 1123 aa  1412    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  100 
 
 		 1123 aa  2150    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  42.57 
 
 		 1121 aa  616  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  40.14 
 
 		 1150 aa  572  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  41.1 
 
 		 1118 aa  529  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  41.69 
 
 		 1153 aa  522  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  40.59 
 
 		 1036 aa  517  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  35.68 
 
 		 1114 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  34.06 
 
 		 1090 aa  411  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  37.41 
 
 		 1161 aa  348  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  33.06 
 
 		 1071 aa  301  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  35.85 
 
 		 1132 aa  300  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  31.64 
 
 		 1148 aa  261  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 1141 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 1141 aa  248  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 489 aa  248  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 1141 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 1141 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 1118 aa  233  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  57.14 
 
 		 655 aa  231  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  46.06 
 
 		 969 aa  221  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 723 aa  209  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  55.29 
 
 		 676 aa  201  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 1151 aa  191  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  32.1 
 
 		 1029 aa  189  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  33.13 
 
 		 1146 aa  186  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  40.11 
 
 		 1000 aa  181  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  36.86 
 
 		 981 aa  178  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  42.34 
 
 		 1030 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  31.79 
 
 		 1054 aa  171  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 1005 aa  170  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  41.97 
 
 		 926 aa  167  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  30.01 
 
 		 1190 aa  167  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  47.15 
 
 		 611 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  38.79 
 
 		 1733 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  33.01 
 
 		 1051 aa  165  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  42.09 
 
 		 1339 aa  164  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  41.35 
 
 		 1003 aa  163  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  41.9 
 
 		 965 aa  160  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  35.19 
 
 		 934 aa  160  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  39.88 
 
 		 910 aa  157  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  37.43 
 
 		 1013 aa  157  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3399  transcriptional regulator, SARP family  43.75 
 
 		 647 aa  156  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00991696  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3349  SARP family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 628 aa  155  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 1198 aa  152  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  36.28 
 
 		 916 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 622 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  30.25 
 
 		 1022 aa  150  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  38.99 
 
 		 1088 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  39.94 
 
 		 1100 aa  149  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  38.79 
 
 		 1125 aa  149  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  37.42 
 
 		 983 aa  147  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  36.83 
 
 		 1022 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  36.48 
 
 		 983 aa  146  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  41.67 
 
 		 1055 aa  145  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 973 aa  145  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.82 
 
 		 1193 aa  145  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  38.46 
 
 		 915 aa  144  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  39.25 
 
 		 378 aa  144  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  40.06 
 
 		 1025 aa  144  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 957 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  37.13 
 
 		 940 aa  142  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.64 
 
 		 1102 aa  142  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  36.6 
 
 		 1699 aa  142  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.43 
 
 		 496 aa  142  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.46 
 
 		 950 aa  141  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  39.26 
 
 		 931 aa  140  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  33.99 
 
 		 996 aa  140  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  38.23 
 
 		 989 aa  139  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.78 
 
 		 921 aa  139  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  35.96 
 
 		 990 aa  139  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.08 
 
 		 1029 aa  138  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 268 aa  137  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 621 aa  137  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 1071 aa  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  34.56 
 
 		 1010 aa  137  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  34.18 
 
 		 992 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  32.64 
 
 		 1108 aa  135  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  39.13 
 
 		 1018 aa  134  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  37.65 
 
 		 1092 aa  134  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 268 aa  134  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  38.32 
 
 		 1103 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  30.59 
 
 		 668 aa  132  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  34.2 
 
 		 1017 aa  132  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  39.35 
 
 		 1186 aa  132  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 979 aa  131  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  37.65 
 
 		 833 aa  131  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  37.28 
 
 		 960 aa  131  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  42.11 
 
 		 385 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  35.03 
 
 		 1093 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 968 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  39.52 
 
 		 379 aa  130  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  35.29 
 
 		 1054 aa  129  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  37.94 
 
 		 1097 aa  129  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 654 aa  129  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 895 aa  128  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 881 aa  128  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 954 aa  128  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  35.13 
 
 		 278 aa  128  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  36.17 
 
 		 971 aa  127  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>