262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0502 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 611 aa  1134    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  46.76 
 
 		 655 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  47.74 
 
 		 676 aa  345  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3349  SARP family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 628 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3399  transcriptional regulator, SARP family  40.6 
 
 		 647 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00991696  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  50.21 
 
 		 1118 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  47.77 
 
 		 1121 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  47.33 
 
 		 1123 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  45.97 
 
 		 1090 aa  183  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  48.97 
 
 		 1036 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 969 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  54.47 
 
 		 1153 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  45.42 
 
 		 489 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  49.34 
 
 		 1150 aa  169  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  45.38 
 
 		 1114 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  47.15 
 
 		 1123 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  39.61 
 
 		 1000 aa  147  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  41.46 
 
 		 1339 aa  147  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.9 
 
 		 1017 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  42.91 
 
 		 1158 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  41.13 
 
 		 1071 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  38.55 
 
 		 943 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  36.45 
 
 		 1018 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  35.78 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  39.92 
 
 		 1013 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  39.68 
 
 		 965 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  39.18 
 
 		 931 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  41.96 
 
 		 1161 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  38.71 
 
 		 1733 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  39.59 
 
 		 1004 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  41.2 
 
 		 1132 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  37.65 
 
 		 981 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  41.7 
 
 		 1146 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  39.27 
 
 		 1003 aa  127  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  35.03 
 
 		 1092 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  40.87 
 
 		 1054 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  37.7 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  39.04 
 
 		 1699 aa  123  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 268 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 1151 aa  120  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  39.53 
 
 		 940 aa  120  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  40.08 
 
 		 1055 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  39.43 
 
 		 1005 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4955  SARP family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 292 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 297 aa  114  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.02 
 
 		 921 aa  114  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  37.1 
 
 		 1017 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  34.55 
 
 		 981 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  34.68 
 
 		 934 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  38.21 
 
 		 1103 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 1058 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37.25 
 
 		 1102 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  37.5 
 
 		 1036 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  35.77 
 
 		 1011 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  37.45 
 
 		 957 aa  110  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 276 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  39.43 
 
 		 935 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  39.11 
 
 		 1125 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.29 
 
 		 952 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  33.76 
 
 		 378 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  36.69 
 
 		 950 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  35 
 
 		 992 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  34.66 
 
 		 962 aa  107  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.03 
 
 		 496 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 268 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.3 
 
 		 1043 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  36.44 
 
 		 1014 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  35.18 
 
 		 1148 aa  105  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 979 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  39.84 
 
 		 926 aa  104  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.92 
 
 		 989 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  31.05 
 
 		 621 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  37.7 
 
 		 963 aa  104  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  34.68 
 
 		 833 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.76 
 
 		 1100 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  35.89 
 
 		 1093 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  34.41 
 
 		 262 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  34.39 
 
 		 990 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 654 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  38.65 
 
 		 668 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  35.14 
 
 		 930 aa  102  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  33.2 
 
 		 1010 aa  102  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 1071 aa  101  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  33.07 
 
 		 921 aa  101  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 622 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30.36 
 
 		 631 aa  100  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  36.03 
 
 		 1088 aa  100  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  36.58 
 
 		 385 aa  100  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3481  SARP family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 277 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  33.88 
 
 		 1021 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  35.74 
 
 		 1025 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  32.13 
 
 		 1003 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 1097 aa  99.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  34.92 
 
 		 928 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 1319 aa  98.2  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  34.16 
 
 		 453 aa  97.4  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  35.12 
 
 		 1042 aa  97.1  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  37.69 
 
 		 1066 aa  97.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  31.45 
 
 		 535 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 1346 aa  96.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>