More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4843 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 
1151 aa  2239    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  43.69 
 
 
1146 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  37.68 
 
 
1339 aa  328  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  40.45 
 
 
668 aa  325  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  31.51 
 
 
786 aa  259  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  29.27 
 
 
1090 aa  184  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  40.8 
 
 
965 aa  178  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  32.82 
 
 
1123 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  31.32 
 
 
1123 aa  176  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  31.68 
 
 
1121 aa  170  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  30.09 
 
 
1141 aa  167  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  29.93 
 
 
723 aa  165  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  31.82 
 
 
1132 aa  164  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  30.75 
 
 
1118 aa  162  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  29.96 
 
 
1118 aa  158  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  33.02 
 
 
1071 aa  156  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  30.06 
 
 
1114 aa  156  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  28.8 
 
 
1148 aa  154  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  29.48 
 
 
1141 aa  153  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  29.48 
 
 
1141 aa  153  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  31.09 
 
 
1141 aa  152  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  32.55 
 
 
1022 aa  150  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.63 
 
 
1150 aa  147  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  36.44 
 
 
1003 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  35.06 
 
 
1102 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.76 
 
 
1193 aa  144  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  33.54 
 
 
1161 aa  144  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  40 
 
 
268 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 
990 aa  141  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  30.33 
 
 
934 aa  139  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  31.95 
 
 
940 aa  137  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  36.76 
 
 
1000 aa  137  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.15 
 
 
981 aa  137  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  31.94 
 
 
981 aa  136  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.31 
 
 
1190 aa  136  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  34.13 
 
 
1092 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.42 
 
 
496 aa  134  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  40.59 
 
 
489 aa  134  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  28.98 
 
 
1071 aa  132  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  35 
 
 
992 aa  132  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  35.91 
 
 
995 aa  131  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  34.73 
 
 
621 aa  131  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  32.02 
 
 
1043 aa  131  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  42.28 
 
 
1025 aa  131  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  33.82 
 
 
1733 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  36.59 
 
 
654 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  29.97 
 
 
1036 aa  129  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  31.74 
 
 
1103 aa  127  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  31.65 
 
 
1030 aa  127  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  34.73 
 
 
535 aa  127  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  28.48 
 
 
952 aa  127  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  32.21 
 
 
1125 aa  125  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  41.63 
 
 
655 aa  125  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  35 
 
 
1017 aa  125  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  34.65 
 
 
926 aa  125  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  34.05 
 
 
941 aa  125  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  40.89 
 
 
676 aa  125  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  34.02 
 
 
1088 aa  124  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  36.58 
 
 
1010 aa  124  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  33.67 
 
 
996 aa  124  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  33.43 
 
 
921 aa  124  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  30.91 
 
 
1020 aa  122  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  35.51 
 
 
990 aa  122  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  38.62 
 
 
611 aa  121  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  37.28 
 
 
378 aa  121  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  29.88 
 
 
1018 aa  120  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  36.5 
 
 
950 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  34.39 
 
 
963 aa  120  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  32.4 
 
 
907 aa  119  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  34.86 
 
 
962 aa  119  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5827  transcriptional regulator, SARP family  36.4 
 
 
264 aa  119  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  34.39 
 
 
993 aa  119  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  30.33 
 
 
1030 aa  118  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  32.43 
 
 
1008 aa  117  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  34.5 
 
 
267 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 
969 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  35.08 
 
 
957 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.41 
 
 
964 aa  116  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  36.13 
 
 
262 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  33.44 
 
 
1003 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.25 
 
 
631 aa  115  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  31.35 
 
 
276 aa  115  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  34.8 
 
 
1158 aa  115  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  33.77 
 
 
1025 aa  115  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  29.46 
 
 
1036 aa  115  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  35.31 
 
 
1033 aa  114  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  25.92 
 
 
1027 aa  114  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  36.12 
 
 
1108 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  35.12 
 
 
1055 aa  114  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  36.59 
 
 
1004 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  30.35 
 
 
758 aa  114  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  34.84 
 
 
1014 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  33.96 
 
 
928 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  34.31 
 
 
930 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  31.31 
 
 
905 aa  112  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  35.18 
 
 
261 aa  112  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  29.57 
 
 
901 aa  111  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  38.04 
 
 
963 aa  111  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  33.85 
 
 
1013 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  33.75 
 
 
1186 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>