More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6794 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  100 
 
 
723 aa  1411    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  67.79 
 
 
1118 aa  895    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  32.96 
 
 
1153 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  31.91 
 
 
1114 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  32.93 
 
 
1121 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  31.88 
 
 
1148 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  30.67 
 
 
1132 aa  198  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  32.41 
 
 
1123 aa  195  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  34.12 
 
 
1161 aa  194  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  30.51 
 
 
1141 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.16 
 
 
1150 aa  185  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  32.2 
 
 
1118 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  31.26 
 
 
1036 aa  173  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  30.23 
 
 
1141 aa  167  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  30 
 
 
1141 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  30 
 
 
1141 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  29.85 
 
 
1151 aa  161  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.7 
 
 
1146 aa  154  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 
1022 aa  151  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  41.63 
 
 
775 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  38.54 
 
 
1054 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  37.43 
 
 
1733 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  36.25 
 
 
1010 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  27.62 
 
 
1090 aa  139  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  32.32 
 
 
1198 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  32.93 
 
 
1054 aa  134  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  37.32 
 
 
1339 aa  127  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  29.51 
 
 
1193 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  35.55 
 
 
1025 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  32.12 
 
 
1027 aa  127  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.95 
 
 
1075 aa  127  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.35 
 
 
1190 aa  124  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  36.11 
 
 
940 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  33.98 
 
 
1000 aa  123  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.85 
 
 
1029 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  35.57 
 
 
1071 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  32.5 
 
 
921 aa  120  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  33.72 
 
 
1699 aa  120  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  35.2 
 
 
1055 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  37.69 
 
 
1088 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  33.02 
 
 
630 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  35.11 
 
 
630 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  33.64 
 
 
990 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.29 
 
 
1015 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  33.12 
 
 
930 aa  118  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  32.65 
 
 
952 aa  117  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  28.17 
 
 
1003 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  34.38 
 
 
1071 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  30.65 
 
 
1022 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  34.2 
 
 
919 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  28.84 
 
 
1029 aa  115  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  34.25 
 
 
969 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  35.4 
 
 
1049 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  31.42 
 
 
900 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  29.63 
 
 
621 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.72 
 
 
1017 aa  112  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.16 
 
 
1013 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  29.87 
 
 
1020 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  27.85 
 
 
1013 aa  111  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  32.82 
 
 
965 aa  111  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.84 
 
 
950 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 
453 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  33.44 
 
 
1092 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  27.08 
 
 
1126 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  28.69 
 
 
1123 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  32.31 
 
 
267 aa  107  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.09 
 
 
1780 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  32.48 
 
 
995 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  33.67 
 
 
983 aa  107  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  34.85 
 
 
1017 aa  107  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  32.52 
 
 
943 aa  107  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  31.97 
 
 
276 aa  107  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 
1403 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  33.03 
 
 
1014 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  35.52 
 
 
1003 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  29.8 
 
 
954 aa  106  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  30.03 
 
 
934 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  31.97 
 
 
907 aa  106  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  28.93 
 
 
992 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  34.3 
 
 
1108 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  32.13 
 
 
423 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  33.24 
 
 
1125 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  27.13 
 
 
1055 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  33.76 
 
 
1103 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  34.06 
 
 
1093 aa  104  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  29.52 
 
 
932 aa  104  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  33.14 
 
 
1102 aa  104  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  36.95 
 
 
378 aa  104  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  33.54 
 
 
1186 aa  104  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.1 
 
 
1141 aa  103  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  32.17 
 
 
1097 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  28.33 
 
 
1067 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.95 
 
 
931 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  34.53 
 
 
1058 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  31.45 
 
 
981 aa  103  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.31 
 
 
921 aa  102  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  32.76 
 
 
910 aa  101  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  31.47 
 
 
597 aa  101  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  32.92 
 
 
602 aa  101  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  31.29 
 
 
990 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.379783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>