More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2962 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  100 
 
 
1013 aa  1983    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  54.09 
 
 
1055 aa  914    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  54.43 
 
 
1029 aa  946    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  31.78 
 
 
1034 aa  334  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  30.86 
 
 
713 aa  206  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  31.72 
 
 
1126 aa  189  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  28.02 
 
 
1163 aa  173  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.21 
 
 
1067 aa  172  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  27.79 
 
 
1143 aa  161  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  27.76 
 
 
1193 aa  160  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  27.77 
 
 
1139 aa  156  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  30.54 
 
 
1015 aa  150  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.9 
 
 
1190 aa  150  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  29.54 
 
 
1089 aa  144  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  33.41 
 
 
494 aa  142  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  33 
 
 
1022 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.25 
 
 
1075 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  30.96 
 
 
1109 aa  137  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  29.16 
 
 
648 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  27.99 
 
 
1083 aa  131  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 
1298 aa  129  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  29.48 
 
 
1121 aa  128  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  28.97 
 
 
1116 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.1 
 
 
1666 aa  125  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  29.31 
 
 
1122 aa  124  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  31.7 
 
 
1118 aa  122  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  24.42 
 
 
1183 aa  121  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  31.28 
 
 
1160 aa  121  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  25.73 
 
 
1216 aa  120  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  32.3 
 
 
954 aa  119  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  27.71 
 
 
1148 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.93 
 
 
1141 aa  118  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
1235 aa  118  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30.86 
 
 
992 aa  117  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  27.62 
 
 
723 aa  116  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  28.72 
 
 
647 aa  115  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  32.18 
 
 
1064 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  27.31 
 
 
1141 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.95 
 
 
1134 aa  111  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.85 
 
 
1080 aa  110  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.27 
 
 
1403 aa  110  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 
900 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  32.21 
 
 
966 aa  110  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  27.1 
 
 
1141 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  27.1 
 
 
1141 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0326  transcriptional regulator, SARP family  28.72 
 
 
647 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  28.25 
 
 
1148 aa  110  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.9 
 
 
1149 aa  108  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  29.57 
 
 
1056 aa  108  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  31.65 
 
 
1044 aa  108  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.15 
 
 
1117 aa  107  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.5 
 
 
1774 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  25.16 
 
 
1227 aa  107  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  28.54 
 
 
1114 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  30.64 
 
 
965 aa  106  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 
1403 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  28.48 
 
 
1118 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.17 
 
 
1081 aa  105  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.86 
 
 
1175 aa  105  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  27.73 
 
 
1005 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  27.35 
 
 
1138 aa  105  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  30.5 
 
 
1007 aa  105  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  29.35 
 
 
993 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  32.48 
 
 
1145 aa  102  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  28.42 
 
 
1118 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  27.05 
 
 
1141 aa  102  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  29.97 
 
 
983 aa  101  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  24.91 
 
 
1123 aa  101  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  29.12 
 
 
1264 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  27.7 
 
 
1123 aa  100  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  28.74 
 
 
967 aa  100  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  28.5 
 
 
1198 aa  99.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  29.33 
 
 
1029 aa  100  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 
1151 aa  100  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.18 
 
 
1150 aa  99.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  27 
 
 
1132 aa  99.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  28.89 
 
 
1151 aa  98.6  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  26.79 
 
 
1422 aa  98.6  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.11 
 
 
1295 aa  98.6  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.95 
 
 
1131 aa  98.2  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
975 aa  98.2  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  27.98 
 
 
1046 aa  97.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.59 
 
 
1291 aa  97.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  34.21 
 
 
992 aa  97.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  26.71 
 
 
1071 aa  95.9  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.4 
 
 
1780 aa  94  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25.92 
 
 
1020 aa  93.6  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  26.53 
 
 
1871 aa  93.6  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  32.92 
 
 
1161 aa  93.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  31.32 
 
 
956 aa  92.8  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  29.35 
 
 
916 aa  92.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  27.76 
 
 
1151 aa  92.4  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.59 
 
 
1805 aa  91.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  26.69 
 
 
1055 aa  91.7  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  29.18 
 
 
927 aa  90.5  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  26.26 
 
 
1139 aa  90.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.95 
 
 
1808 aa  89  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  25.45 
 
 
1105 aa  89.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.67 
 
 
1006 aa  89.4  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.63 
 
 
1780 aa  89  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>