More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6166 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
1139 aa  2297    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  68.62 
 
 
1138 aa  1470    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  60.58 
 
 
1141 aa  1313    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  59.67 
 
 
1149 aa  1219    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  60.37 
 
 
1151 aa  1277    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  59.93 
 
 
1148 aa  1289    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  60.63 
 
 
1151 aa  1295    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  32.34 
 
 
1105 aa  536  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.03 
 
 
1117 aa  528  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  32.35 
 
 
1048 aa  511  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  35.34 
 
 
1122 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  34.94 
 
 
1063 aa  402  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  29.56 
 
 
1134 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  30.66 
 
 
1377 aa  358  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.82 
 
 
1081 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 
1403 aa  342  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  31.64 
 
 
1093 aa  341  5e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.04 
 
 
1291 aa  335  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  28.36 
 
 
1037 aa  331  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.13 
 
 
1080 aa  330  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  30.75 
 
 
1043 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.2 
 
 
1089 aa  319  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  30.02 
 
 
1065 aa  313  9e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.7 
 
 
1175 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.72 
 
 
1050 aa  297  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  28.72 
 
 
1050 aa  297  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.73 
 
 
1053 aa  296  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  28.67 
 
 
1046 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.24 
 
 
1055 aa  296  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 
1402 aa  291  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  30.41 
 
 
1227 aa  289  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  29.97 
 
 
1160 aa  283  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.79 
 
 
1014 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  27.7 
 
 
1055 aa  257  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  27.52 
 
 
1123 aa  253  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.31 
 
 
1403 aa  243  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  28.85 
 
 
1142 aa  241  6.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.79 
 
 
1126 aa  237  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.07 
 
 
1429 aa  229  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  27.73 
 
 
1094 aa  224  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.72 
 
 
1360 aa  223  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  25.37 
 
 
1271 aa  218  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  27.14 
 
 
1133 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.89 
 
 
1023 aa  216  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 
1298 aa  215  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 
1398 aa  211  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.35 
 
 
1295 aa  210  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 
1027 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.99 
 
 
1422 aa  208  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  27.76 
 
 
1027 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  27.76 
 
 
1027 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.6 
 
 
1441 aa  202  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.97 
 
 
1226 aa  200  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  29.82 
 
 
1198 aa  199  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  29.06 
 
 
1204 aa  188  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.57 
 
 
1087 aa  184  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.7 
 
 
1096 aa  184  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  25.84 
 
 
1358 aa  182  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.78 
 
 
1285 aa  179  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.21 
 
 
1190 aa  173  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  21.59 
 
 
1153 aa  161  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  26.24 
 
 
1067 aa  157  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  25.27 
 
 
1311 aa  157  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  26.23 
 
 
1264 aa  152  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.94 
 
 
1190 aa  150  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  25.59 
 
 
1349 aa  148  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  25.21 
 
 
1348 aa  145  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  24.22 
 
 
1342 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  24.22 
 
 
1349 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  24.22 
 
 
1349 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  24.39 
 
 
1353 aa  140  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  25.03 
 
 
1289 aa  139  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  27.4 
 
 
992 aa  134  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  27.39 
 
 
993 aa  131  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  36.97 
 
 
665 aa  129  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  32.57 
 
 
320 aa  129  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  32.57 
 
 
320 aa  129  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  29.28 
 
 
916 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.31 
 
 
1015 aa  125  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  32.82 
 
 
735 aa  125  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  28.48 
 
 
983 aa  124  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.86 
 
 
858 aa  124  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  24.37 
 
 
1359 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  29.55 
 
 
1034 aa  123  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.76 
 
 
1055 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.66 
 
 
1029 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  33.59 
 
 
859 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  24.28 
 
 
1213 aa  121  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  24.18 
 
 
1350 aa  121  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  24.18 
 
 
1359 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  24.18 
 
 
1359 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  24.18 
 
 
1359 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  24.18 
 
 
1359 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  25.74 
 
 
1130 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  24.57 
 
 
1169 aa  119  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  24.67 
 
 
914 aa  119  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  34.18 
 
 
744 aa  118  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  35.94 
 
 
518 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  32.09 
 
 
864 aa  117  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.22 
 
 
805 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>