More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4989 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  52.3 
 
 		 1213 aa  993    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  97.03 
 
 		 1349 aa  2491    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  53.05 
 
 		 1359 aa  1084    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  80.25 
 
 		 956 aa  1483    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  53.74 
 
 		 1353 aa  1135    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  89.05 
 
 		 1342 aa  2303    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  89.25 
 
 		 1349 aa  2332    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 1348 aa  2666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  89.25 
 
 		 1349 aa  2332    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  53.05 
 
 		 1359 aa  1082    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  53.05 
 
 		 1350 aa  1081    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  53.16 
 
 		 1359 aa  1093    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  53.19 
 
 		 1359 aa  1086    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  53.05 
 
 		 1359 aa  1082    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  34 
 
 		 1398 aa  571  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 		 1311 aa  519  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.74 
 
 		 1403 aa  432  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  28.2 
 
 		 1402 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26.94 
 
 		 1105 aa  223  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  26 
 
 		 1122 aa  214  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  42.91 
 
 		 1818 aa  202  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  26.49 
 
 		 1377 aa  183  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  26.4 
 
 		 1358 aa  180  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  24.67 
 
 		 1046 aa  179  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  23.23 
 
 		 1048 aa  177  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.58 
 
 		 1141 aa  175  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  24.54 
 
 		 1148 aa  171  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.57 
 
 		 1175 aa  171  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.61 
 
 		 1149 aa  168  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  26.13 
 
 		 1037 aa  164  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  28.21 
 
 		 1227 aa  163  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.47 
 
 		 1151 aa  157  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  25.65 
 
 		 1043 aa  157  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  24.41 
 
 		 1151 aa  156  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0362  serine/threonine protein kinase  35.59 
 
 		 632 aa  154  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  36.12 
 
 		 613 aa  152  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.02 
 
 		 1117 aa  147  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  25.12 
 
 		 1065 aa  144  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  36.96 
 
 		 623 aa  143  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  24.48 
 
 		 1138 aa  142  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  36.46 
 
 		 667 aa  142  3.9999999999999997e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.9 
 
 		 658 aa  142  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4114  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 		 513 aa  142  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  36.59 
 
 		 614 aa  142  4.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  39.15 
 
 		 690 aa  142  6e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  35.76 
 
 		 614 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 		 646 aa  141  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.87 
 
 		 518 aa  140  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3790  serine/threonine protein kinase  34.77 
 
 		 487 aa  140  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000242747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.3 
 
 		 603 aa  140  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3707  serine/threonine protein kinase  34.77 
 
 		 480 aa  140  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2110  serine/threonine protein kinase  37.25 
 
 		 451 aa  140  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2040  serine/threonine protein kinase  37.25 
 
 		 451 aa  140  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00475654  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 		 582 aa  140  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.28 
 
 		 676 aa  140  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  36.28 
 
 		 586 aa  139  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.94 
 
 		 499 aa  139  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  34.45 
 
 		 666 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  39.22 
 
 		 1104 aa  139  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  37.32 
 
 		 763 aa  139  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  39.13 
 
 		 623 aa  139  5e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  27.73 
 
 		 1133 aa  138  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.26 
 
 		 681 aa  138  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 750 aa  138  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.59 
 
 		 503 aa  138  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1820  serine/threonine protein kinase  36.22 
 
 		 451 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.672727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  37.23 
 
 		 517 aa  137  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  36.14 
 
 		 736 aa  137  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.01 
 
 		 562 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  34.28 
 
 		 862 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1394  serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 		 501 aa  137  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.860745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 568 aa  137  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0329  protein kinase  38.15 
 
 		 615 aa  136  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0711079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3624  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 		 552 aa  136  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401978  decreased coverage  0.000211559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  36.88 
 
 		 661 aa  136  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  33.95 
 
 		 645 aa  136  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  33.9 
 
 		 1122 aa  136  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  38.26 
 
 		 651 aa  135  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4569  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.46 
 
 		 655 aa  135  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.967984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 		 611 aa  135  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  38.31 
 
 		 519 aa  135  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  34.38 
 
 		 565 aa  135  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  35.95 
 
 		 757 aa  135  6e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  36.76 
 
 		 624 aa  135  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  36.76 
 
 		 624 aa  135  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  36.76 
 
 		 624 aa  135  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3649  serine/threonine protein kinase  34.59 
 
 		 450 aa  135  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 		 783 aa  134  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.45 
 
 		 747 aa  134  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.52 
 
 		 647 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 		 707 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4621  adenylate/guanylate cyclase  34.81 
 
 		 687 aa  134  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.828122 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1754  serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 		 470 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00149548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 		 776 aa  134  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0491  serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 		 1070 aa  133  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.424967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.99 
 
 		 798 aa  132  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  36.03 
 
 		 502 aa  132  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  38.18 
 
 		 480 aa  132  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  35.14 
 
 		 626 aa  132  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.77 
 
 		 700 aa  132  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0200783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>