More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1960 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  91.4 
 
 
1081 aa  1961    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  61.78 
 
 
1089 aa  1321    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  100 
 
 
1080 aa  2180    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  36.91 
 
 
1160 aa  395  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.17 
 
 
1141 aa  365  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  29.05 
 
 
1093 aa  365  3e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  32.46 
 
 
1148 aa  348  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  32.85 
 
 
1151 aa  335  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.77 
 
 
1151 aa  327  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  32.42 
 
 
1138 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 
1139 aa  310  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 
1142 aa  308  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.18 
 
 
1291 aa  308  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.97 
 
 
1149 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
1094 aa  303  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.41 
 
 
1429 aa  301  6e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.43 
 
 
1422 aa  297  9e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  28.13 
 
 
1123 aa  291  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  30.17 
 
 
1134 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.45 
 
 
1403 aa  273  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.05 
 
 
1055 aa  255  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.35 
 
 
1360 aa  253  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  29.75 
 
 
1050 aa  251  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.75 
 
 
1050 aa  251  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.65 
 
 
1175 aa  249  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.52 
 
 
1441 aa  249  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  28.44 
 
 
1105 aa  249  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.04 
 
 
1053 aa  245  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  30.52 
 
 
1063 aa  245  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  31.95 
 
 
1227 aa  238  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.93 
 
 
1226 aa  229  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.98 
 
 
1295 aa  228  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.2 
 
 
1014 aa  221  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  30.63 
 
 
1198 aa  219  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  23.19 
 
 
1153 aa  219  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  32.2 
 
 
1122 aa  218  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  26.62 
 
 
1048 aa  217  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.36 
 
 
1117 aa  212  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.76 
 
 
1190 aa  210  9e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 
1096 aa  209  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  30.1 
 
 
1055 aa  207  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.15 
 
 
1285 aa  206  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  28.04 
 
 
1046 aa  205  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  27.89 
 
 
1037 aa  199  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  30.03 
 
 
1204 aa  196  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  28.3 
 
 
1271 aa  194  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.49 
 
 
1190 aa  191  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  28.34 
 
 
1043 aa  178  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 
1403 aa  177  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  29.86 
 
 
1065 aa  163  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  27.09 
 
 
1402 aa  162  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.2 
 
 
1087 aa  160  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.65 
 
 
1468 aa  143  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  39.9 
 
 
665 aa  143  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  27.39 
 
 
1264 aa  140  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  31.77 
 
 
1126 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  38.19 
 
 
518 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  27.58 
 
 
1398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  28.73 
 
 
992 aa  132  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  30.72 
 
 
916 aa  131  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  40 
 
 
518 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  39.02 
 
 
515 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 
1235 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  39.89 
 
 
1020 aa  128  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  26.56 
 
 
1377 aa  128  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  26.48 
 
 
1169 aa  128  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  31.87 
 
 
320 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  31.87 
 
 
320 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  36.9 
 
 
746 aa  125  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  37.17 
 
 
513 aa  124  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  35.62 
 
 
859 aa  124  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 
864 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.91 
 
 
852 aa  122  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.18 
 
 
1023 aa  121  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 
641 aa  121  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  32.92 
 
 
526 aa  121  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  35.82 
 
 
717 aa  121  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  36.41 
 
 
483 aa  121  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  25.31 
 
 
1130 aa  121  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  36.41 
 
 
483 aa  120  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.32 
 
 
858 aa  120  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  34.7 
 
 
524 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33 
 
 
861 aa  119  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  37.63 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.24 
 
 
611 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  31 
 
 
860 aa  119  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  37.04 
 
 
758 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  31.47 
 
 
479 aa  119  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  26.19 
 
 
1358 aa  118  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  36.26 
 
 
546 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.63 
 
 
678 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  34.38 
 
 
638 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  29.83 
 
 
966 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.89 
 
 
701 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  34.2 
 
 
546 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.71 
 
 
954 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 
959 aa  116  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  33.04 
 
 
529 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  39.22 
 
 
971 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.94 
 
 
805 aa  115  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>