More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0558 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
665 aa  1358    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  34.97 
 
 
746 aa  279  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.82 
 
 
658 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.75 
 
 
758 aa  251  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  30.54 
 
 
670 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.33 
 
 
696 aa  234  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.25 
 
 
656 aa  229  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  33.14 
 
 
794 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  29.02 
 
 
614 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.78 
 
 
672 aa  225  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  32.3 
 
 
752 aa  221  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.19 
 
 
758 aa  220  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.95 
 
 
611 aa  210  6e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  32.13 
 
 
734 aa  210  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  29.27 
 
 
729 aa  207  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  29.32 
 
 
667 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.89 
 
 
652 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  31.16 
 
 
741 aa  204  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  35.17 
 
 
936 aa  204  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  29.36 
 
 
758 aa  200  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.26 
 
 
723 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  29.01 
 
 
758 aa  197  7e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  27.38 
 
 
744 aa  196  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  27.7 
 
 
638 aa  194  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.93 
 
 
723 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.34 
 
 
701 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 
696 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.13 
 
 
764 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  28.21 
 
 
701 aa  189  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  28.62 
 
 
759 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  28.6 
 
 
717 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  27.46 
 
 
760 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  41.67 
 
 
738 aa  183  9.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  40.87 
 
 
479 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  30.05 
 
 
729 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.04 
 
 
737 aa  179  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  45.27 
 
 
524 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.59 
 
 
754 aa  174  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  41.44 
 
 
526 aa  173  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  26.94 
 
 
725 aa  172  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  43.4 
 
 
529 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  43.2 
 
 
526 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30 
 
 
761 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  41.3 
 
 
859 aa  171  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.24 
 
 
657 aa  171  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  40.18 
 
 
460 aa  170  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  41.26 
 
 
462 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  39.64 
 
 
662 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  40.09 
 
 
864 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  39.46 
 
 
465 aa  167  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  24.42 
 
 
738 aa  167  5e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.22 
 
 
753 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  40.18 
 
 
463 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  37.24 
 
 
694 aa  166  9e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  39.73 
 
 
446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  39.44 
 
 
532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.46 
 
 
656 aa  165  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  40.34 
 
 
546 aa  163  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  26.19 
 
 
744 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  39.04 
 
 
518 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  26.53 
 
 
607 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.33 
 
 
757 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1662  adenylate/guanylate cyclase  37.01 
 
 
472 aa  161  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.491568  hitchhiker  0.000617786 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  29.13 
 
 
645 aa  161  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  35.65 
 
 
431 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  39.47 
 
 
515 aa  161  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  25.31 
 
 
756 aa  160  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  27.12 
 
 
731 aa  160  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  38.57 
 
 
662 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  36.11 
 
 
441 aa  159  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  36.16 
 
 
702 aa  159  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  41.1 
 
 
858 aa  158  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  29.4 
 
 
735 aa  158  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  35.63 
 
 
528 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
1207 aa  157  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  41.71 
 
 
861 aa  157  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  39.11 
 
 
561 aa  156  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  38.53 
 
 
513 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  38.14 
 
 
701 aa  151  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2124  adenylate/guanylate cyclase  35.4 
 
 
516 aa  150  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  37.09 
 
 
701 aa  150  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  41.49 
 
 
860 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  35.44 
 
 
518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  24.64 
 
 
721 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  37.39 
 
 
971 aa  148  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  34.81 
 
 
632 aa  147  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  33.47 
 
 
911 aa  147  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.87 
 
 
703 aa  147  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  41.35 
 
 
650 aa  146  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  39.8 
 
 
1081 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  39.9 
 
 
1080 aa  143  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  35.14 
 
 
969 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  37.09 
 
 
546 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  37.82 
 
 
593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  34.88 
 
 
523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  24.83 
 
 
582 aa  139  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  35.81 
 
 
483 aa  138  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  35.37 
 
 
483 aa  138  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  36.16 
 
 
487 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.2 
 
 
577 aa  137  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>