More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6648 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  44.02 
 
 		 1122 aa  776    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 1048 aa  2129    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  32.57 
 
 		 1105 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  32.35 
 
 		 1139 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.84 
 
 		 1141 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  33.24 
 
 		 1377 aa  467  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  34.6 
 
 		 1043 aa  459  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 		 1403 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  39.41 
 
 		 1227 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  32.11 
 
 		 1138 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  31.05 
 
 		 1148 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.36 
 
 		 1175 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  30.52 
 
 		 1037 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 		 1151 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 		 1151 aa  436  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.75 
 
 		 1149 aa  429  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  33.2 
 
 		 1065 aa  422  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  30.78 
 
 		 1055 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 		 1046 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  30.15 
 
 		 1402 aa  359  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.05 
 
 		 1117 aa  345  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  29.51 
 
 		 1027 aa  331  4e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  29.28 
 
 		 1027 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  29.28 
 
 		 1027 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 		 1398 aa  312  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.79 
 
 		 1087 aa  288  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.41 
 
 		 1134 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  28.32 
 
 		 1093 aa  264  6e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.7 
 
 		 1291 aa  261  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  31.38 
 
 		 1160 aa  258  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  26.8 
 
 		 1358 aa  254  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  31.7 
 
 		 1198 aa  239  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.94 
 
 		 1089 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  26.19 
 
 		 1133 aa  235  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.94 
 
 		 1023 aa  233  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  25.43 
 
 		 1311 aa  228  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.34 
 
 		 1403 aa  224  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  27.93 
 
 		 1142 aa  219  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  28.55 
 
 		 1094 aa  214  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.18 
 
 		 1422 aa  214  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.62 
 
 		 1080 aa  214  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.43 
 
 		 1081 aa  214  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.79 
 
 		 1360 aa  211  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.25 
 
 		 1429 aa  203  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.82 
 
 		 1126 aa  194  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  27.63 
 
 		 1063 aa  193  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.85 
 
 		 1055 aa  193  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  28.39 
 
 		 1271 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  23.44 
 
 		 1349 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  27.19 
 
 		 1050 aa  185  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.19 
 
 		 1050 aa  185  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  25.38 
 
 		 1123 aa  183  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.97 
 
 		 1014 aa  183  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  23.82 
 
 		 1342 aa  179  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  23.72 
 
 		 1349 aa  178  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  23.72 
 
 		 1349 aa  178  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.7 
 
 		 1053 aa  177  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  24.55 
 
 		 1353 aa  174  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  23.13 
 
 		 1348 aa  174  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  28.62 
 
 		 914 aa  173  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.65 
 
 		 1295 aa  166  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.34 
 
 		 1096 aa  160  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.35 
 
 		 1441 aa  158  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1298 aa  156  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  25.6 
 
 		 1067 aa  154  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.06 
 
 		 1190 aa  141  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  25.26 
 
 		 956 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.78 
 
 		 805 aa  140  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  26.48 
 
 		 1289 aa  137  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  26.44 
 
 		 1264 aa  134  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  20.66 
 
 		 1153 aa  132  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  28.9 
 
 		 1204 aa  130  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 		 1190 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.93 
 
 		 1226 aa  122  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  38.83 
 
 		 518 aa  121  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  22.96 
 
 		 1826 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 979 aa  113  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  24.24 
 
 		 1169 aa  108  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  30.5 
 
 		 983 aa  107  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.02 
 
 		 1006 aa  107  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  25.1 
 
 		 1320 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.7 
 
 		 1029 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  25.47 
 
 		 1130 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  33.66 
 
 		 515 aa  106  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  34.15 
 
 		 518 aa  104  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  26.45 
 
 		 919 aa  104  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  34.09 
 
 		 665 aa  103  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.84 
 
 		 1285 aa  102  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.78 
 
 		 637 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  24.3 
 
 		 916 aa  99.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  33.52 
 
 		 643 aa  99.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  30.86 
 
 		 546 aa  98.6  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 1190 aa  97.8  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1662  adenylate/guanylate cyclase  28.06 
 
 		 472 aa  96.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.491568  hitchhiker  0.000617786 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.59 
 
 		 1075 aa  96.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  26.29 
 
 		 1422 aa  96.3  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  26.43 
 
 		 900 aa  95.5  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  26.32 
 
 		 950 aa  94.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.61 
 
 		 1468 aa  94.7  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  24.39 
 
 		 1340 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>