More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2730 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.31 
 
 		 1441 aa  979    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  79.15 
 
 		 1422 aa  2178    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 1429 aa  2851    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.17 
 
 		 1360 aa  482  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.4 
 
 		 1403 aa  468  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.37 
 
 		 1295 aa  386  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 		 1271 aa  382  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 1298 aa  333  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 		 1093 aa  310  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.51 
 
 		 1080 aa  302  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.66 
 
 		 1089 aa  298  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.36 
 
 		 1081 aa  285  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  28.37 
 
 		 1160 aa  271  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.96 
 
 		 1175 aa  254  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  29.44 
 
 		 1134 aa  250  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.41 
 
 		 1141 aa  245  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  25.91 
 
 		 1130 aa  241  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  27.59 
 
 		 1123 aa  235  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  29.09 
 
 		 1264 aa  234  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  26.77 
 
 		 1148 aa  229  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  27.06 
 
 		 1227 aa  229  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  30.22 
 
 		 1122 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.13 
 
 		 1149 aa  223  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.23 
 
 		 1151 aa  220  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  27.4 
 
 		 1151 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  29.35 
 
 		 1139 aa  218  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  28.32 
 
 		 1105 aa  216  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  26.92 
 
 		 1169 aa  215  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  29.71 
 
 		 1138 aa  212  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  28.25 
 
 		 1048 aa  210  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.48 
 
 		 1117 aa  202  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.39 
 
 		 1403 aa  202  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.13 
 
 		 1055 aa  197  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.03 
 
 		 1291 aa  196  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  30.14 
 
 		 1050 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.14 
 
 		 1050 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 		 1063 aa  192  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.33 
 
 		 1053 aa  178  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  18.98 
 
 		 1153 aa  177  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  25.76 
 
 		 1142 aa  169  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  26.44 
 
 		 1094 aa  167  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.85 
 
 		 1190 aa  157  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  27.72 
 
 		 1043 aa  157  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  26.74 
 
 		 1046 aa  156  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  29.03 
 
 		 1204 aa  155  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.62 
 
 		 1096 aa  155  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.42 
 
 		 1014 aa  154  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  25.47 
 
 		 1037 aa  153  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.62 
 
 		 1226 aa  145  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.78 
 
 		 1285 aa  144  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  28.15 
 
 		 1065 aa  141  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  27.38 
 
 		 1402 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.41 
 
 		 782 aa  139  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2252  adenylate/guanylate cyclase  27.04 
 
 		 508 aa  137  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.154815  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  21.19 
 
 		 1147 aa  135  6.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  26.11 
 
 		 1198 aa  132  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  24.05 
 
 		 1055 aa  129  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.21 
 
 		 1022 aa  129  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  26.83 
 
 		 1029 aa  128  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.52 
 
 		 852 aa  127  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  31.96 
 
 		 983 aa  126  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.93 
 
 		 1190 aa  126  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.56 
 
 		 1468 aa  125  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 1015 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  28.51 
 
 		 914 aa  122  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  29.2 
 
 		 954 aa  121  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  26.52 
 
 		 1055 aa  121  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  25.99 
 
 		 1358 aa  120  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  29.38 
 
 		 1133 aa  119  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.47 
 
 		 1087 aa  119  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  30.37 
 
 		 1006 aa  115  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  27.35 
 
 		 1235 aa  114  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  26.78 
 
 		 1027 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25.59 
 
 		 1020 aa  114  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.01 
 
 		 1023 aa  113  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  24.4 
 
 		 1398 aa  112  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  29.26 
 
 		 993 aa  112  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1313 aa  112  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  25.41 
 
 		 1320 aa  112  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  23.7 
 
 		 1666 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  26.71 
 
 		 1027 aa  110  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 		 1311 aa  110  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  26.71 
 
 		 1027 aa  110  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  26.23 
 
 		 1005 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  34.22 
 
 		 735 aa  108  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  31.58 
 
 		 513 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  26.86 
 
 		 1190 aa  107  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  28.18 
 
 		 1289 aa  106  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  26.37 
 
 		 1349 aa  105  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  26.37 
 
 		 1349 aa  105  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  27.63 
 
 		 1193 aa  105  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1238 aa  105  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 900 aa  105  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  26.37 
 
 		 1342 aa  104  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  28.08 
 
 		 1067 aa  103  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  29.76 
 
 		 966 aa  103  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.84 
 
 		 1075 aa  103  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  29.48 
 
 		 759 aa  102  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.19 
 
 		 597 aa  102  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.07 
 
 		 1150 aa  101  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>