More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2662 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  79.15 
 
 		 1429 aa  2219    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 		 1422 aa  2842    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  43.16 
 
 		 1441 aa  989    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.67 
 
 		 1360 aa  492  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.74 
 
 		 1403 aa  487  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  28.87 
 
 		 1271 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.71 
 
 		 1295 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 		 1298 aa  333  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.93 
 
 		 1080 aa  319  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.52 
 
 		 1089 aa  303  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 		 1093 aa  299  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.49 
 
 		 1081 aa  297  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.82 
 
 		 1160 aa  270  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  30.94 
 
 		 1134 aa  265  6e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.88 
 
 		 1175 aa  261  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  28.34 
 
 		 1123 aa  251  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.55 
 
 		 1141 aa  249  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  30.81 
 
 		 1122 aa  228  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  31.72 
 
 		 1227 aa  225  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  25.13 
 
 		 1130 aa  223  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 1048 aa  222  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  28.56 
 
 		 1264 aa  221  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  29.02 
 
 		 1148 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.68 
 
 		 1149 aa  215  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.61 
 
 		 1117 aa  214  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  25.51 
 
 		 1169 aa  214  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.44 
 
 		 1151 aa  212  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  26.91 
 
 		 1138 aa  209  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.42 
 
 		 1403 aa  207  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  27.5 
 
 		 1105 aa  207  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  27.1 
 
 		 1151 aa  207  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.1 
 
 		 1055 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.13 
 
 		 1291 aa  206  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  29.99 
 
 		 1139 aa  203  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  31.49 
 
 		 1050 aa  200  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.49 
 
 		 1050 aa  200  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  29.43 
 
 		 1063 aa  199  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.18 
 
 		 1053 aa  189  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  27.26 
 
 		 1142 aa  179  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  28.91 
 
 		 1043 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  28.29 
 
 		 1046 aa  174  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  27.64 
 
 		 1094 aa  173  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.69 
 
 		 1014 aa  169  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  26.98 
 
 		 1204 aa  167  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  25.22 
 
 		 1037 aa  160  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  30.98 
 
 		 1402 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  27.85 
 
 		 1065 aa  159  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  19.16 
 
 		 1153 aa  158  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.83 
 
 		 1285 aa  150  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  28.47 
 
 		 1198 aa  148  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  27.25 
 
 		 1055 aa  148  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2252  adenylate/guanylate cyclase  26.92 
 
 		 508 aa  143  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.154815  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.38 
 
 		 1096 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.04 
 
 		 1190 aa  140  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  28.35 
 
 		 1027 aa  139  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.06 
 
 		 1226 aa  139  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  28.19 
 
 		 1027 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  28.19 
 
 		 1027 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  21.13 
 
 		 1147 aa  134  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.35 
 
 		 1029 aa  133  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.2 
 
 		 852 aa  134  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  25.82 
 
 		 1358 aa  134  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  31.44 
 
 		 983 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25.47 
 
 		 782 aa  128  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 1015 aa  127  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.16 
 
 		 1022 aa  127  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  26.5 
 
 		 1005 aa  126  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.07 
 
 		 1087 aa  125  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 		 1320 aa  125  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  27.43 
 
 		 1311 aa  125  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.11 
 
 		 1055 aa  124  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 954 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  31.82 
 
 		 914 aa  120  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.63 
 
 		 1023 aa  119  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.04 
 
 		 1190 aa  119  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.68 
 
 		 1666 aa  118  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  28.54 
 
 		 1235 aa  118  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  27.96 
 
 		 1133 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  26.32 
 
 		 1377 aa  116  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  31.09 
 
 		 1006 aa  116  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  26.43 
 
 		 1020 aa  115  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  24.53 
 
 		 1398 aa  115  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1682  putative adenylate/guanylate cyclase  29.45 
 
 		 1071 aa  114  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 1193 aa  114  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  31.08 
 
 		 966 aa  113  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.34 
 
 		 1190 aa  113  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  30.17 
 
 		 696 aa  111  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  24.89 
 
 		 967 aa  109  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.91 
 
 		 1150 aa  109  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.23 
 
 		 900 aa  108  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 		 1346 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  28.94 
 
 		 916 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 		 1348 aa  105  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  28.74 
 
 		 1289 aa  105  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  26.48 
 
 		 1349 aa  105  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  26.48 
 
 		 1349 aa  105  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  28.86 
 
 		 993 aa  105  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  26.13 
 
 		 1349 aa  105  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.64 
 
 		 761 aa  105  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  26.48 
 
 		 1342 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>