More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3945 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1402 aa  2821    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  37.88 
 
 
1403 aa  816    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 
1398 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 
1311 aa  482  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  30.54 
 
 
1353 aa  398  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
1349 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
1349 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 
1342 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  30.25 
 
 
1048 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 
1349 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  29.74 
 
 
1359 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  29.99 
 
 
1359 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  29.92 
 
 
1359 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  29.92 
 
 
1359 aa  380  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  29.92 
 
 
1350 aa  380  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  29.92 
 
 
1359 aa  380  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 
1348 aa  376  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  31.09 
 
 
1122 aa  373  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  29.65 
 
 
1105 aa  352  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  31.15 
 
 
956 aa  335  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  28.75 
 
 
1213 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.66 
 
 
1141 aa  325  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.9 
 
 
1151 aa  310  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  28.64 
 
 
1148 aa  309  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  28.62 
 
 
1151 aa  304  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.85 
 
 
1149 aa  296  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  27.68 
 
 
1139 aa  293  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.02 
 
 
1117 aa  293  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  27.47 
 
 
1138 aa  280  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  30.59 
 
 
1043 aa  277  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  27.74 
 
 
1358 aa  273  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  31.1 
 
 
1065 aa  258  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  48.45 
 
 
1818 aa  258  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  29.26 
 
 
1377 aa  258  8e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.71 
 
 
1175 aa  256  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  29.93 
 
 
1227 aa  254  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  27.12 
 
 
1046 aa  252  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  26.98 
 
 
1055 aa  242  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  26.13 
 
 
1037 aa  214  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  25.78 
 
 
1134 aa  204  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.25 
 
 
1160 aa  204  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.55 
 
 
1089 aa  197  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  26.66 
 
 
1093 aa  192  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.52 
 
 
1360 aa  183  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.12 
 
 
1126 aa  179  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.03 
 
 
1403 aa  177  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.94 
 
 
1441 aa  176  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  26.8 
 
 
1133 aa  176  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.18 
 
 
1422 aa  174  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.09 
 
 
1081 aa  174  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 
1289 aa  172  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.09 
 
 
1080 aa  172  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.43 
 
 
1468 aa  171  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.27 
 
 
1023 aa  170  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  37.54 
 
 
776 aa  170  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  35.49 
 
 
614 aa  170  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  26.43 
 
 
1050 aa  169  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.43 
 
 
1050 aa  169  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3163  serine/threonine protein kinase  38.62 
 
 
761 aa  168  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.923539  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5516  serine/threonine protein kinase  36.01 
 
 
512 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262851  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.64 
 
 
627 aa  167  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  25.85 
 
 
1142 aa  167  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  37.59 
 
 
673 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 
625 aa  166  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.32 
 
 
667 aa  166  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  35.62 
 
 
604 aa  166  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5322  serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 
671 aa  165  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  38.18 
 
 
596 aa  164  9e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.54 
 
 
1291 aa  162  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  34.82 
 
 
790 aa  161  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  38.24 
 
 
559 aa  160  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  34.29 
 
 
692 aa  160  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  38.38 
 
 
623 aa  161  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  36.97 
 
 
651 aa  160  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4435  serine/threonine protein kinase  40.07 
 
 
542 aa  160  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  33.93 
 
 
691 aa  160  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  26.18 
 
 
1067 aa  159  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  38.79 
 
 
763 aa  159  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  34.63 
 
 
666 aa  158  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.54 
 
 
635 aa  158  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 
651 aa  158  8e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  38.52 
 
 
620 aa  157  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.83 
 
 
1429 aa  157  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  39.61 
 
 
565 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  34.84 
 
 
664 aa  156  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  34.84 
 
 
664 aa  156  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  25.08 
 
 
1094 aa  155  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  36.3 
 
 
612 aa  154  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  35.87 
 
 
692 aa  154  8.999999999999999e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  37.94 
 
 
1122 aa  154  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3488  serine/threonine protein kinase  35.54 
 
 
524 aa  154  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.562336  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  37.86 
 
 
450 aa  154  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  35 
 
 
638 aa  153  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
614 aa  153  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.91 
 
 
562 aa  154  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.94 
 
 
632 aa  154  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  25.94 
 
 
1271 aa  153  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.86 
 
 
551 aa  152  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.85 
 
 
676 aa  152  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  37.28 
 
 
646 aa  152  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>