More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1991 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 
1023 aa  2068    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.47 
 
 
1122 aa  292  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26.11 
 
 
1105 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  25.84 
 
 
1048 aa  250  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  27.76 
 
 
1148 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  26.12 
 
 
1037 aa  242  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  28.21 
 
 
1377 aa  236  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  26.33 
 
 
1046 aa  224  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.4 
 
 
1175 aa  220  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  27.41 
 
 
1055 aa  217  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  26.96 
 
 
1139 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  27.07 
 
 
1403 aa  209  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.25 
 
 
1151 aa  208  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  26.45 
 
 
1043 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  26.1 
 
 
1151 aa  205  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.84 
 
 
1149 aa  204  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  26.71 
 
 
1138 aa  197  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  28.66 
 
 
1134 aa  193  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  30.09 
 
 
1065 aa  192  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.52 
 
 
1141 aa  191  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  25.93 
 
 
1133 aa  178  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  26.38 
 
 
1402 aa  171  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.88 
 
 
1160 aa  161  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.8 
 
 
1117 aa  159  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.85 
 
 
1089 aa  153  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  25.13 
 
 
1311 aa  151  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  26.93 
 
 
1227 aa  150  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  27.89 
 
 
1198 aa  144  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  24.1 
 
 
1398 aa  143  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.58 
 
 
1055 aa  140  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.41 
 
 
1291 aa  140  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  26.86 
 
 
1050 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.86 
 
 
1050 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  26.52 
 
 
1094 aa  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  27.05 
 
 
1142 aa  135  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.19 
 
 
1080 aa  135  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.18 
 
 
1014 aa  132  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  27.24 
 
 
1063 aa  132  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.48 
 
 
1422 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.73 
 
 
1081 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  22.98 
 
 
1349 aa  128  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.71 
 
 
1053 aa  128  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  23.01 
 
 
1093 aa  128  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  29.85 
 
 
914 aa  125  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  22.47 
 
 
1348 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  23.92 
 
 
1123 aa  122  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  24.31 
 
 
1358 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.74 
 
 
1429 aa  119  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.67 
 
 
1126 aa  118  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  24.81 
 
 
1271 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.02 
 
 
1087 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  26.1 
 
 
956 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.31 
 
 
1295 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  23.36 
 
 
1349 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  23.36 
 
 
1349 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  23.25 
 
 
1342 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.07 
 
 
1096 aa  104  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  26.24 
 
 
1027 aa  104  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  25.93 
 
 
1067 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  27.05 
 
 
1006 aa  101  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  25.66 
 
 
1027 aa  101  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  25.66 
 
 
1027 aa  101  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  29.87 
 
 
966 aa  97.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  26.45 
 
 
1353 aa  95.1  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.6 
 
 
1403 aa  92  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  27.45 
 
 
954 aa  90.1  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.59 
 
 
1441 aa  90.1  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.88 
 
 
805 aa  89  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  30.49 
 
 
983 aa  88.2  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  26.48 
 
 
916 aa  87.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  24.81 
 
 
1022 aa  86.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  25.54 
 
 
1005 aa  87  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  27.3 
 
 
919 aa  85.1  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.89 
 
 
900 aa  85.1  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  26.44 
 
 
1213 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  26.44 
 
 
1350 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  26.44 
 
 
1359 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  26.44 
 
 
1359 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  26.58 
 
 
1183 aa  82  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  24.49 
 
 
1289 aa  81.6  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  24.44 
 
 
1346 aa  80.9  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.43 
 
 
1029 aa  80.9  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  27.16 
 
 
1169 aa  79.7  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  24.67 
 
 
1340 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  26.44 
 
 
1359 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  26.44 
 
 
1359 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  26.44 
 
 
1359 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  28.77 
 
 
1013 aa  78.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  25.91 
 
 
973 aa  78.2  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.41 
 
 
1468 aa  77  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  25.12 
 
 
967 aa  77  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 
1383 aa  75.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  19.62 
 
 
1153 aa  75.1  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  24.5 
 
 
1264 aa  74.3  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.66 
 
 
1360 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  25.45 
 
 
940 aa  73.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.95 
 
 
1285 aa  72.8  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  25.21 
 
 
1422 aa  72  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  27.39 
 
 
1204 aa  71.6  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  26.59 
 
 
881 aa  71.2  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>