More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1636 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 
1126 aa  2242    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  35.01 
 
 
1067 aa  468  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  43.98 
 
 
494 aa  351  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.34 
 
 
1141 aa  261  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.89 
 
 
1149 aa  259  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  29.92 
 
 
1148 aa  248  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  28.94 
 
 
1122 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  29.3 
 
 
1105 aa  244  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  30.16 
 
 
1151 aa  241  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  28.79 
 
 
1139 aa  240  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.03 
 
 
1029 aa  239  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  31.1 
 
 
1055 aa  234  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.23 
 
 
1151 aa  233  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.46 
 
 
1117 aa  230  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  28.3 
 
 
1138 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  26.82 
 
 
1048 aa  213  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  31.6 
 
 
1013 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 
1402 aa  189  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  29.58 
 
 
1193 aa  181  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  27.23 
 
 
1377 aa  181  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.19 
 
 
1190 aa  179  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  26.3 
 
 
1398 aa  176  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  27.69 
 
 
1034 aa  171  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  29.34 
 
 
1015 aa  171  8e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  28.36 
 
 
1139 aa  167  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.77 
 
 
1080 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.61 
 
 
1075 aa  154  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  25.47 
 
 
1403 aa  154  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  27.25 
 
 
713 aa  154  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  26.77 
 
 
1349 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  26.77 
 
 
1349 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 
1342 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  27.18 
 
 
1037 aa  146  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  24.72 
 
 
1046 aa  141  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  32.03 
 
 
992 aa  141  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  27.65 
 
 
1141 aa  140  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  27.65 
 
 
1141 aa  140  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.8 
 
 
1081 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  26.76 
 
 
1123 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  28.3 
 
 
1217 aa  137  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  27.71 
 
 
1116 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  27.5 
 
 
1141 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  26.1 
 
 
1349 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  28.8 
 
 
1143 aa  135  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  28.3 
 
 
1109 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  26.01 
 
 
1183 aa  134  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  26.39 
 
 
1348 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  29.37 
 
 
1089 aa  132  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  26.25 
 
 
1043 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  30.29 
 
 
1022 aa  130  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  28.12 
 
 
1118 aa  129  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  30.08 
 
 
1198 aa  127  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  33.56 
 
 
1235 aa  127  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.24 
 
 
1089 aa  127  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25.98 
 
 
1020 aa  126  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.41 
 
 
1175 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  28.12 
 
 
967 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.33 
 
 
1023 aa  123  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  27.01 
 
 
1118 aa  121  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  26.99 
 
 
1227 aa  121  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  27.93 
 
 
1132 aa  120  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  27.33 
 
 
1141 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.42 
 
 
1160 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  26.87 
 
 
1118 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  27.2 
 
 
1353 aa  119  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  25.85 
 
 
1311 aa  119  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  28.8 
 
 
916 aa  119  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  29.03 
 
 
1071 aa  118  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  26.24 
 
 
1121 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.5 
 
 
1403 aa  114  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  30.02 
 
 
983 aa  114  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  24.82 
 
 
1055 aa  114  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.15 
 
 
1666 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  32.18 
 
 
1064 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.33 
 
 
900 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  26 
 
 
1148 aa  110  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  28.1 
 
 
999 aa  110  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  27.03 
 
 
1836 aa  109  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  26.48 
 
 
1123 aa  108  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  30.37 
 
 
966 aa  108  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  27.26 
 
 
1216 aa  108  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
973 aa  107  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  27.61 
 
 
1133 aa  107  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.55 
 
 
1774 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  26.22 
 
 
1697 aa  106  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  27.21 
 
 
1264 aa  105  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.83 
 
 
1797 aa  105  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  25.5 
 
 
972 aa  105  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  27.12 
 
 
1712 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  25.31 
 
 
1668 aa  103  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  23.36 
 
 
2303 aa  102  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.9 
 
 
1291 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  27.49 
 
 
1054 aa  102  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  26.06 
 
 
1114 aa  102  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  26.26 
 
 
993 aa  102  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  26.59 
 
 
1422 aa  102  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  30.23 
 
 
572 aa  101  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  25.56 
 
 
723 aa  101  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  33.75 
 
 
1044 aa  101  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  26.14 
 
 
1142 aa  101  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>