More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4424 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 		 1055 aa  2051    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  54.09 
 
 		 1013 aa  907    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  73.5 
 
 		 1029 aa  1430    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  31.77 
 
 		 1034 aa  321  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  30.79 
 
 		 1126 aa  226  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  30.78 
 
 		 1067 aa  215  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  28.87 
 
 		 713 aa  200  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  29.96 
 
 		 1193 aa  192  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  28.98 
 
 		 1139 aa  185  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 1190 aa  179  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 1116 aa  179  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  28.17 
 
 		 1163 aa  179  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 1089 aa  177  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  28.81 
 
 		 1143 aa  172  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  30.23 
 
 		 1109 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.91 
 
 		 1075 aa  162  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  34.67 
 
 		 1022 aa  159  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 1015 aa  153  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  30.89 
 
 		 1118 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  31.32 
 
 		 1118 aa  149  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  30.56 
 
 		 494 aa  141  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.41 
 
 		 1149 aa  138  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 1216 aa  138  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  27.52 
 
 		 1083 aa  135  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  28.46 
 
 		 1148 aa  135  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.79 
 
 		 1422 aa  134  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  28.24 
 
 		 1121 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.21 
 
 		 1429 aa  133  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 648 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  34.57 
 
 		 966 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  33.07 
 
 		 954 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.86 
 
 		 1141 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 		 1298 aa  129  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.49 
 
 		 1360 aa  127  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  25.38 
 
 		 1123 aa  127  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  28.64 
 
 		 1139 aa  125  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.49 
 
 		 992 aa  123  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  27.25 
 
 		 1138 aa  122  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 		 1235 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  30.41 
 
 		 967 aa  121  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  27.78 
 
 		 1132 aa  121  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  29.48 
 
 		 1118 aa  121  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  31.16 
 
 		 1051 aa  121  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  28.46 
 
 		 1160 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.05 
 
 		 1122 aa  119  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  32.01 
 
 		 916 aa  118  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 1141 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  29.36 
 
 		 1029 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  27.53 
 
 		 647 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0326  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 		 647 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 		 1105 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  27.7 
 
 		 1148 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 1064 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.98 
 
 		 1117 aa  116  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.44 
 
 		 1403 aa  116  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  28.38 
 
 		 1134 aa  115  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  34.97 
 
 		 1044 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  31.68 
 
 		 983 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  27.13 
 
 		 723 aa  114  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.39 
 
 		 1403 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  24.1 
 
 		 1271 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  27.26 
 
 		 1123 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  27.13 
 
 		 1227 aa  112  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.92 
 
 		 1666 aa  112  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  31.77 
 
 		 1054 aa  110  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  28.25 
 
 		 1055 aa  110  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.29 
 
 		 1150 aa  109  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  27.02 
 
 		 1151 aa  109  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.13 
 
 		 1291 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 1030 aa  108  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.02 
 
 		 1151 aa  108  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  29.98 
 
 		 973 aa  108  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  27.98 
 
 		 1114 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  28.48 
 
 		 1005 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.33 
 
 		 1441 aa  106  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  28.89 
 
 		 1123 aa  106  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  29.29 
 
 		 1056 aa  107  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.1 
 
 		 1175 aa  105  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  34.05 
 
 		 956 aa  105  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.54 
 
 		 1295 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  29.75 
 
 		 1006 aa  103  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  27.27 
 
 		 1183 aa  103  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  31.25 
 
 		 1145 aa  102  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  27.08 
 
 		 1046 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  27.55 
 
 		 998 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  33.44 
 
 		 992 aa  102  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  29.07 
 
 		 1198 aa  101  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.68 
 
 		 900 aa  101  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.5 
 
 		 1080 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  27.59 
 
 		 1833 aa  100  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  27.31 
 
 		 1071 aa  100  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  29.74 
 
 		 965 aa  100  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  37.53 
 
 		 1161 aa  99.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  27.62 
 
 		 1264 aa  98.6  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  30.55 
 
 		 1013 aa  98.2  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  28.28 
 
 		 993 aa  97.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  29.22 
 
 		 1422 aa  96.3  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.81 
 
 		 1774 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  32.11 
 
 		 549 aa  95.9  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  33.88 
 
 		 999 aa  94  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>