More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4346 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 1030 aa  1977    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  36.85 
 
 		 956 aa  364  6e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  32.02 
 
 		 998 aa  317  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  34.24 
 
 		 956 aa  220  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  29.64 
 
 		 895 aa  156  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  42.15 
 
 		 981 aa  155  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 1015 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  34.81 
 
 		 1055 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  32.19 
 
 		 1029 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  27.28 
 
 		 959 aa  115  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  26.47 
 
 		 1089 aa  114  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 950 aa  113  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  26.5 
 
 		 1006 aa  107  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.46 
 
 		 1022 aa  100  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  27.8 
 
 		 1005 aa  99  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  30.35 
 
 		 916 aa  98.2  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.63 
 
 		 1067 aa  97.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.16 
 
 		 1080 aa  97.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  29.89 
 
 		 922 aa  97.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.85 
 
 		 900 aa  97.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.18 
 
 		 1146 aa  97.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  27.51 
 
 		 967 aa  96.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.77 
 
 		 1117 aa  95.1  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  26.92 
 
 		 929 aa  95.1  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  27.94 
 
 		 1118 aa  93.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  28.3 
 
 		 993 aa  93.6  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4074  serine/threonine protein kinase  29.4 
 
 		 1297 aa  92.8  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0173368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.54 
 
 		 1055 aa  91.3  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  30.9 
 
 		 983 aa  90.9  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  29.95 
 
 		 1013 aa  90.9  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 973 aa  90.5  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  26.26 
 
 		 713 aa  90.1  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.92 
 
 		 1081 aa  90.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  27.88 
 
 		 1094 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.41 
 
 		 1141 aa  88.2  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  29.98 
 
 		 905 aa  87.8  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  27.64 
 
 		 1034 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  30.54 
 
 		 1029 aa  85.9  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  31.51 
 
 		 948 aa  85.9  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.89 
 
 		 919 aa  85.9  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.03 
 
 		 1666 aa  85.1  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.71 
 
 		 1422 aa  85.1  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  30.48 
 
 		 932 aa  84.7  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  30.69 
 
 		 909 aa  84.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  28.4 
 
 		 974 aa  84.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  27.7 
 
 		 2272 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  26.57 
 
 		 2303 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.12 
 
 		 1131 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  25.87 
 
 		 1148 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  30.9 
 
 		 1013 aa  82.4  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.94 
 
 		 1403 aa  82.4  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  29.73 
 
 		 928 aa  82  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  25.96 
 
 		 1142 aa  82  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  29.47 
 
 		 1132 aa  81.6  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 1190 aa  81.6  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  28.96 
 
 		 953 aa  81.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 1403 aa  81.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.74 
 
 		 1134 aa  81.3  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  27.94 
 
 		 1163 aa  81.3  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 1198 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  24.81 
 
 		 1811 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  26.88 
 
 		 1151 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.09 
 
 		 1151 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 723 aa  79.7  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  27.8 
 
 		 1148 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  28.54 
 
 		 1063 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  28.94 
 
 		 1101 aa  79  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.42 
 
 		 1122 aa  78.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  27.54 
 
 		 954 aa  78.2  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  28.94 
 
 		 940 aa  78.2  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  29.13 
 
 		 1126 aa  77.4  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  22.87 
 
 		 1850 aa  77.4  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  27.9 
 
 		 1349 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 		 960 aa  77.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  27.9 
 
 		 1349 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  28.11 
 
 		 1342 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  27.25 
 
 		 1193 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.42 
 
 		 1429 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.55 
 
 		 1160 aa  76.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  29.11 
 
 		 1139 aa  77  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  26.85 
 
 		 1114 aa  76.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  27.34 
 
 		 1712 aa  76.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 1141 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 1141 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.18 
 
 		 1014 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.62 
 
 		 1795 aa  75.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  29.21 
 
 		 1922 aa  75.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  31.14 
 
 		 1833 aa  75.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.29 
 
 		 1149 aa  75.5  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.14 
 
 		 1797 aa  75.5  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  28.03 
 
 		 1885 aa  75.5  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.73 
 
 		 1089 aa  75.5  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0515  ATPase-like  22.28 
 
 		 1079 aa  75.1  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  26.3 
 
 		 1050 aa  75.1  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  30.75 
 
 		 965 aa  75.1  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.3 
 
 		 1050 aa  75.1  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  31.31 
 
 		 892 aa  75.1  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  23.99 
 
 		 1271 aa  74.7  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.48 
 
 		 1150 aa  74.7  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  28.23 
 
 		 1141 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>