More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2785 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 1013 aa  1960    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 900 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 973 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  38.43 
 
 		 954 aa  363  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  38.25 
 
 		 967 aa  360  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  41.47 
 
 		 999 aa  267  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 959 aa  247  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  40.39 
 
 		 983 aa  239  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 1084 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  33.02 
 
 		 916 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  30.36 
 
 		 1005 aa  193  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  36.1 
 
 		 1006 aa  191  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  32.42 
 
 		 970 aa  180  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  36.65 
 
 		 993 aa  177  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  29.29 
 
 		 964 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  33.39 
 
 		 982 aa  169  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  38.21 
 
 		 953 aa  157  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 937 aa  149  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  33.73 
 
 		 967 aa  141  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  34.2 
 
 		 1054 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  32.8 
 
 		 1022 aa  130  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.36 
 
 		 1295 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25.55 
 
 		 1020 aa  118  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.27 
 
 		 1134 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.14 
 
 		 1029 aa  114  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  31.07 
 
 		 1105 aa  108  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 1015 aa  106  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  29.95 
 
 		 1029 aa  105  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  30.46 
 
 		 713 aa  105  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.98 
 
 		 1160 aa  105  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  23.8 
 
 		 1123 aa  104  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.25 
 
 		 1175 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  29.48 
 
 		 1227 aa  104  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  27.74 
 
 		 1142 aa  103  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.42 
 
 		 1422 aa  103  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  29.83 
 
 		 1034 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 1235 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  32.27 
 
 		 998 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  29.26 
 
 		 1071 aa  99.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 1116 aa  99  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 		 1403 aa  98.6  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  29.79 
 
 		 1094 aa  98.2  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  31.45 
 
 		 1051 aa  98.2  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.67 
 
 		 1291 aa  98.2  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.42 
 
 		 1441 aa  97.8  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  29.69 
 
 		 1067 aa  97.8  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  30.88 
 
 		 862 aa  97.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  32.77 
 
 		 1109 aa  97.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 1198 aa  96.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  32.96 
 
 		 966 aa  95.5  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.39 
 
 		 1081 aa  94.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  32.43 
 
 		 1123 aa  94.7  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 		 1398 aa  94.4  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28 
 
 		 1080 aa  93.2  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.05 
 
 		 1429 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  31.54 
 
 		 1118 aa  92.8  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  26.68 
 
 		 1046 aa  92.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  32.26 
 
 		 1118 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  31.73 
 
 		 938 aa  90.9  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 1141 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 1141 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 1141 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  28.21 
 
 		 1123 aa  89  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 1118 aa  89  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  26.96 
 
 		 1402 aa  88.2  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  31.14 
 
 		 1121 aa  87.4  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  30.88 
 
 		 1133 aa  87.4  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  33.43 
 
 		 937 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  23.9 
 
 		 1048 aa  85.9  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  30.35 
 
 		 1075 aa  85.5  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 952 aa  84.7  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 952 aa  84.7  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.58 
 
 		 1403 aa  84  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  30.55 
 
 		 1055 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  24.44 
 
 		 1422 aa  84.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  23.46 
 
 		 1914 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26 
 
 		 1089 aa  84  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  25.66 
 
 		 1055 aa  83.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 1193 aa  82.8  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  26.74 
 
 		 977 aa  82.8  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 895 aa  82.4  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.17 
 
 		 1149 aa  81.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.76 
 
 		 1055 aa  81.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 1141 aa  81.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  27.27 
 
 		 1126 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  29.92 
 
 		 932 aa  80.5  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  24.63 
 
 		 1139 aa  80.1  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  24.66 
 
 		 1271 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 867 aa  79.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24 
 
 		 1141 aa  78.2  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 		 1349 aa  78.2  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 881 aa  78.2  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 		 1348 aa  77.8  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  30.77 
 
 		 1114 aa  77.8  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  26.71 
 
 		 1093 aa  77.4  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  26.17 
 
 		 1668 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  23.23 
 
 		 1147 aa  77.8  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 1148 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 		 1383 aa  76.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.37 
 
 		 1190 aa  76.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>