265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0243 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  100 
 
 
1083 aa  2125    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  43.01 
 
 
1143 aa  543  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  42.37 
 
 
647 aa  350  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  42.18 
 
 
648 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0326  transcriptional regulator, SARP family  42.37 
 
 
647 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  33.18 
 
 
1163 aa  221  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.83 
 
 
1029 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  25.79 
 
 
1139 aa  137  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  27.52 
 
 
1055 aa  135  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  28.13 
 
 
1013 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.08 
 
 
1067 aa  110  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  27.42 
 
 
1089 aa  106  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  26.56 
 
 
1034 aa  105  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
973 aa  99  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.25 
 
 
1190 aa  94  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 
1235 aa  85.1  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  29.58 
 
 
494 aa  83.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  25.92 
 
 
967 aa  81.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  27.38 
 
 
1193 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  25.68 
 
 
1148 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  26.99 
 
 
1114 aa  77.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  26.83 
 
 
1141 aa  77.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  25.65 
 
 
1141 aa  75.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  25.65 
 
 
1141 aa  75.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  27.45 
 
 
1151 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  25.27 
 
 
1148 aa  74.7  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  28.64 
 
 
1056 aa  74.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.97 
 
 
1291 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  24.95 
 
 
1141 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.37 
 
 
1126 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.41 
 
 
1151 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  26.84 
 
 
1833 aa  71.2  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.78 
 
 
1295 aa  70.1  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
1298 aa  69.7  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  26.64 
 
 
1071 aa  69.3  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.88 
 
 
1429 aa  69.3  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  26.17 
 
 
1075 aa  68.9  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  25.9 
 
 
1121 aa  68.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.46 
 
 
1666 aa  68.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  22.58 
 
 
1134 aa  67.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  29.03 
 
 
1550 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  23.8 
 
 
1183 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  32.14 
 
 
2145 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  25.66 
 
 
1118 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  25.31 
 
 
1216 aa  65.1  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.72 
 
 
1131 aa  64.7  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.55 
 
 
1422 aa  64.7  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  30.35 
 
 
992 aa  64.3  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  25.6 
 
 
713 aa  63.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  28.96 
 
 
725 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.84 
 
 
1805 aa  62.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.31 
 
 
1780 aa  62.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  27.41 
 
 
1118 aa  62.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  25.21 
 
 
723 aa  62.4  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  28.35 
 
 
1212 aa  62.4  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  23.47 
 
 
1151 aa  62  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.86 
 
 
782 aa  62  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  33.47 
 
 
1064 aa  62  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.81 
 
 
1141 aa  61.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  22.38 
 
 
1123 aa  60.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  36.17 
 
 
1145 aa  60.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  25.57 
 
 
992 aa  60.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  24.71 
 
 
1871 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.67 
 
 
1175 aa  60.1  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  23.88 
 
 
1020 aa  59.3  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  23.76 
 
 
1908 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.6 
 
 
1942 aa  59.7  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  27.47 
 
 
954 aa  58.9  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.38 
 
 
1288 aa  58.5  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  25.87 
 
 
1836 aa  58.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  25.36 
 
 
1710 aa  58.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  31.48 
 
 
775 aa  58.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  32.39 
 
 
1044 aa  57.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2486  transcriptional regulator, SARP family  38.78 
 
 
270 aa  57.4  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  25.13 
 
 
809 aa  58.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  25.98 
 
 
1132 aa  57.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  28.76 
 
 
1022 aa  57.4  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24 
 
 
1797 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.8 
 
 
1808 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  25.81 
 
 
2272 aa  57  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  23.71 
 
 
1160 aa  57.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  27.96 
 
 
963 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  25.5 
 
 
1037 aa  56.2  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
1276 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.46 
 
 
1804 aa  55.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 
1398 aa  55.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2409  transcriptional regulator, SARP family  39.42 
 
 
244 aa  55.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.18 
 
 
1441 aa  55.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  23.03 
 
 
1271 aa  55.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  25.42 
 
 
1837 aa  55.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  25.37 
 
 
1123 aa  55.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  26.4 
 
 
1266 aa  55.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
465 aa  55.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.3 
 
 
1694 aa  55.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.88 
 
 
1009 aa  55.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  32.43 
 
 
1979 aa  55.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.07 
 
 
1795 aa  55.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 
1025 aa  55.1  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.97 
 
 
1087 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  30.23 
 
 
929 aa  55.1  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>