90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2486 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2486  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 270 aa  529  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2409  transcriptional regulator, SARP family  55.79 
 
 		 244 aa  229  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  45.85 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2691  SARP family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2507  transcriptional activator domain-containing protein  48.58 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0440426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1963  transcriptional regulator, SARP family  41.23 
 
 		 248 aa  145  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0662749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1158  transcriptional regulator, SARP family  41.85 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2088  transcriptional regulator, SARP family  44.1 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  31.25 
 
 		 1067 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  31.33 
 
 		 494 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  31.98 
 
 		 1126 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  27.6 
 
 		 1034 aa  68.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 636 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  29.41 
 
 		 1055 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.32 
 
 		 1029 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  31.25 
 
 		 1083 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  28.29 
 
 		 1094 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  30.77 
 
 		 1075 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  30.8 
 
 		 1018 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  29.19 
 
 		 992 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  38.78 
 
 		 1083 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 1050 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  29.27 
 
 		 1139 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  28.04 
 
 		 1145 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 1064 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 1116 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  27.91 
 
 		 999 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0326  transcriptional regulator, SARP family  36.55 
 
 		 647 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  27.82 
 
 		 1010 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  38.33 
 
 		 965 aa  55.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  36.55 
 
 		 647 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  26.83 
 
 		 1095 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 1089 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.49 
 
 		 1190 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  28.02 
 
 		 1204 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 648 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  32.48 
 
 		 1143 aa  52.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  28.57 
 
 		 1108 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 1193 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  33.33 
 
 		 1044 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  39.81 
 
 		 1005 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  27.52 
 
 		 1163 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  28.27 
 
 		 1013 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  28.15 
 
 		 597 aa  48.9  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  27.1 
 
 		 650 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  32.99 
 
 		 1097 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  26.83 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.75 
 
 		 496 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  29.08 
 
 		 1003 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  29.41 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 1100 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  37.78 
 
 		 1000 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  28.5 
 
 		 1064 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  22.38 
 
 		 365 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  38.14 
 
 		 655 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  27.08 
 
 		 1082 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  42.68 
 
 		 1094 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  33.73 
 
 		 1118 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  31.62 
 
 		 1090 aa  45.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  30.41 
 
 		 1102 aa  45.8  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  30.11 
 
 		 1030 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2867  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 449 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  30.36 
 
 		 1028 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.76 
 
 		 1058 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  29.96 
 
 		 1048 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  30.65 
 
 		 661 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  30.5 
 
 		 1118 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  22.04 
 
 		 1111 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  31.52 
 
 		 1109 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  22.56 
 
 		 1056 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  30.5 
 
 		 1118 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 621 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  25.89 
 
 		 1017 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  31.03 
 
 		 535 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  25 
 
 		 775 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  32.76 
 
 		 775 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  26.36 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  25 
 
 		 1217 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  33.9 
 
 		 940 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  37.76 
 
 		 935 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  26.6 
 
 		 713 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  32.38 
 
 		 1018 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  27.7 
 
 		 1163 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  37.96 
 
 		 668 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  34.57 
 
 		 957 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 654 aa  42.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 1071 aa  42.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 931 aa  42  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3158  response regulator receiver protein  30.21 
 
 		 446 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>