166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0253 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  100 
 
 		 661 aa  1320    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 423 aa  114  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  30.89 
 
 		 1095 aa  104  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  30.08 
 
 		 1094 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  33.05 
 
 		 1097 aa  99.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  33.19 
 
 		 1083 aa  95.5  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  29.96 
 
 		 572 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  30.4 
 
 		 1145 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  33.07 
 
 		 1163 aa  90.1  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  29.65 
 
 		 1204 aa  89  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 1116 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 1193 aa  87.4  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 1190 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.69 
 
 		 561 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  26.91 
 
 		 1111 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  30.08 
 
 		 1118 aa  84.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  30.08 
 
 		 1118 aa  84.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  28.63 
 
 		 999 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 775 aa  81.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  30.64 
 
 		 1109 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  29.69 
 
 		 1108 aa  81.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  32.64 
 
 		 1064 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  30.22 
 
 		 1071 aa  78.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2405  transcriptional activator domain protein  31.6 
 
 		 1025 aa  78.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.375799  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  29.54 
 
 		 1018 aa  77.4  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  28.89 
 
 		 597 aa  69.3  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2867  response regulator receiver protein  30.12 
 
 		 449 aa  69.7  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2272  transcriptional regulator domain protein  30.56 
 
 		 925 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0573653  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  29.52 
 
 		 1067 aa  68.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  28.7 
 
 		 1055 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  31.62 
 
 		 689 aa  67  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2694  response regulator receiver and SARP domain protein  26.69 
 
 		 435 aa  66.6  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  29.08 
 
 		 1733 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  32.34 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 1064 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3158  response regulator receiver protein  27.82 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  27.95 
 
 		 867 aa  63.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.23 
 
 		 1339 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  28.28 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  30.95 
 
 		 1119 aa  61.6  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  29.36 
 
 		 1118 aa  61.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1911  transcriptional regulator domain protein  29.21 
 
 		 990 aa  61.2  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.345318  decreased coverage  0.000588756 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09000  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  26.36 
 
 		 831 aa  60.8  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178339 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  27.75 
 
 		 1126 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1552  SARP family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 289 aa  60.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  0.0981278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  29.44 
 
 		 1010 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  27.31 
 
 		 1061 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  28.05 
 
 		 1003 aa  58.9  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1244  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  23.35 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  30.3 
 
 		 1121 aa  58.9  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  30.91 
 
 		 1102 aa  58.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  30.77 
 
 		 1000 aa  57.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  28.57 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 1048 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  27.64 
 
 		 655 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  29.87 
 
 		 940 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05450  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  24.9 
 
 		 907 aa  55.5  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2199  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  30.58 
 
 		 344 aa  55.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.425276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  32.26 
 
 		 993 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  37.14 
 
 		 234 aa  54.7  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0404  TPR repeat-containing protein  20.07 
 
 		 1055 aa  54.7  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.56 
 
 		 1150 aa  54.7  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  34.75 
 
 		 908 aa  55.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  34.75 
 
 		 1044 aa  54.7  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  29.29 
 
 		 676 aa  54.3  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  29.15 
 
 		 649 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 1050 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  32.41 
 
 		 770 aa  53.5  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  27.31 
 
 		 1000 aa  52.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  30.2 
 
 		 1050 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  27.04 
 
 		 1090 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  22.86 
 
 		 1082 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  29.38 
 
 		 494 aa  52  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.08 
 
 		 230 aa  51.6  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  29.13 
 
 		 1100 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1624  SARP family transcriptional regulator  19.55 
 
 		 349 aa  51.2  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  19.37 
 
 		 349 aa  51.2  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1771  hypothetical protein  24.63 
 
 		 215 aa  50.8  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  28.39 
 
 		 1118 aa  50.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  29.1 
 
 		 1014 aa  50.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  31.08 
 
 		 262 aa  50.8  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0439  SARP family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 630 aa  50.8  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.235011 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24290  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  24.67 
 
 		 392 aa  50.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.11 
 
 		 230 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1852  SARP family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 212 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.31253e-17  normal  0.969216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  29.33 
 
 		 379 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  24.9 
 
 		 1148 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 969 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  31.46 
 
 		 240 aa  49.7  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2470  response regulator receiver and SARP domain protein  25.94 
 
 		 242 aa  49.7  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0497  response regulator receiver and SARP domain protein  25.54 
 
 		 363 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000475999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  32 
 
 		 1025 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 1141 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  30.24 
 
 		 1049 aa  48.9  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  23.47 
 
 		 365 aa  48.9  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  26.51 
 
 		 985 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 226 aa  48.5  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>