250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6503 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 252 aa  506  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  39.92 
 
 		 621 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  38.1 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  41.67 
 
 		 631 aa  169  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  39.29 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 654 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  40.64 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  38.89 
 
 		 1020 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  40.49 
 
 		 378 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  36.73 
 
 		 993 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  39.04 
 
 		 950 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  37.05 
 
 		 992 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  39.76 
 
 		 370 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.22 
 
 		 957 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.6 
 
 		 496 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  38.1 
 
 		 1000 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  34.52 
 
 		 1022 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  41.05 
 
 		 990 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  36.4 
 
 		 995 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  36.11 
 
 		 1186 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  36.29 
 
 		 453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  36.73 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  36 
 
 		 990 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.97 
 
 		 921 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  36 
 
 		 968 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  39.04 
 
 		 1092 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 268 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.4 
 
 		 1013 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  35.6 
 
 		 385 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.92 
 
 		 960 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  37.75 
 
 		 930 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  34.66 
 
 		 965 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.65 
 
 		 931 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  33.99 
 
 		 981 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  37.15 
 
 		 1033 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  35.71 
 
 		 1088 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  37.2 
 
 		 1025 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  34.8 
 
 		 1003 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  34.1 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  36.25 
 
 		 1339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  36 
 
 		 1014 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  35.18 
 
 		 992 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  33.6 
 
 		 388 aa  125  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  37.89 
 
 		 926 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  36.03 
 
 		 1021 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  34.15 
 
 		 940 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  35.86 
 
 		 1110 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  33.47 
 
 		 1093 aa  122  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  35.86 
 
 		 1158 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 1043 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  29.2 
 
 		 1108 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  36.65 
 
 		 1056 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  34.8 
 
 		 1030 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 935 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 622 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  34.52 
 
 		 1097 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  37.25 
 
 		 971 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  34.13 
 
 		 1010 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  37.85 
 
 		 1025 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  32.67 
 
 		 1058 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  32.54 
 
 		 934 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  32.8 
 
 		 833 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  35.55 
 
 		 1005 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  34.92 
 
 		 1121 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  37.85 
 
 		 1072 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  35.2 
 
 		 983 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  34.77 
 
 		 1058 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.8 
 
 		 919 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 1071 aa  119  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  35.32 
 
 		 907 aa  118  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5827  transcriptional regulator, SARP family  35.71 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3489  SARP family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148382  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 282 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  34.94 
 
 		 1030 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  36.86 
 
 		 963 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  34.78 
 
 		 946 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  35.34 
 
 		 1042 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  36.36 
 
 		 666 aa  115  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1004 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  34.55 
 
 		 1733 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  34.14 
 
 		 954 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  30.65 
 
 		 535 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4209  transcriptional regulator, SARP family  32.4 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 		 1028 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  34.89 
 
 		 937 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 952 aa  111  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  34.13 
 
 		 921 aa  111  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  34.13 
 
 		 941 aa  111  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  34.25 
 
 		 1102 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  36.4 
 
 		 1087 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  32.8 
 
 		 1090 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 621 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  34.01 
 
 		 910 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  35.06 
 
 		 1055 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  35.57 
 
 		 1050 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 		 1054 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 		 956 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 		 1022 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>