242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3489 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3489  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 
257 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148382  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  39.6 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  41.63 
 
 
268 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  38.82 
 
 
1022 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  39.37 
 
 
1013 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  39.92 
 
 
621 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  38.55 
 
 
378 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  38.93 
 
 
453 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  38.25 
 
 
278 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  40.31 
 
 
1000 aa  142  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  35.52 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  36.5 
 
 
990 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  39.18 
 
 
654 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.87 
 
 
950 aa  138  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.55 
 
 
631 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  35.74 
 
 
833 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  41.43 
 
 
1088 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  35.51 
 
 
388 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  37.7 
 
 
622 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  37.5 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  40.96 
 
 
1055 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  36.12 
 
 
934 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  39.29 
 
 
1339 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  40.24 
 
 
954 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  37.02 
 
 
1005 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  36.11 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  36.59 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  41.13 
 
 
1025 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  37.25 
 
 
940 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  39.74 
 
 
582 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  39.22 
 
 
989 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  37.1 
 
 
1108 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  35.89 
 
 
993 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  38.43 
 
 
965 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.24 
 
 
496 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  37.35 
 
 
1020 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  37.35 
 
 
919 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.26 
 
 
1102 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  38.4 
 
 
1148 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  40.24 
 
 
668 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 
957 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  36.29 
 
 
992 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  37.01 
 
 
1030 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  37.55 
 
 
1733 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.02 
 
 
960 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  35.59 
 
 
996 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  36.33 
 
 
981 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  36.22 
 
 
995 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38 
 
 
1092 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  35.52 
 
 
981 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  35.29 
 
 
1003 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  38.62 
 
 
1110 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  36.61 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  38.06 
 
 
1021 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  34.25 
 
 
992 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  34.82 
 
 
968 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  35.97 
 
 
983 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  35.66 
 
 
1071 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  35.63 
 
 
941 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  38.25 
 
 
1146 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  35.74 
 
 
1017 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  34.92 
 
 
1011 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  37.65 
 
 
1018 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  33.71 
 
 
1123 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  37.6 
 
 
1141 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 
969 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  36.19 
 
 
760 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  37.8 
 
 
1025 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  32.81 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  37.14 
 
 
666 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  37.55 
 
 
1072 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 
931 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  34.27 
 
 
379 aa  112  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2444  SARP family transcriptional regulator  34.25 
 
 
259 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.467324  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  39.11 
 
 
910 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  36.1 
 
 
1093 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4955  SARP family transcriptional regulator  34.27 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220858  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  36.73 
 
 
1003 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 
1186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  36.69 
 
 
1158 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36 
 
 
1125 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4209  transcriptional regulator, SARP family  33.58 
 
 
271 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  37.35 
 
 
1008 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  33.47 
 
 
964 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  34.88 
 
 
1048 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.58 
 
 
1103 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 
1058 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  36.47 
 
 
971 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  31.6 
 
 
1004 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  36.47 
 
 
1123 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  37.55 
 
 
926 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  38.06 
 
 
1036 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  35.86 
 
 
1097 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  37.39 
 
 
962 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  34.29 
 
 
1118 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  38.15 
 
 
1056 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  35.22 
 
 
1100 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.4 
 
 
921 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  32.92 
 
 
602 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
489 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>