More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3159 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 968 aa  1910    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  32.29 
 
 		 833 aa  332  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  58.87 
 
 		 919 aa  297  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4451  transcriptional regulator, SARP family  51.2 
 
 		 266 aa  226  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 979 aa  211  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 654 aa  171  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  37.65 
 
 		 1108 aa  166  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  42.34 
 
 		 1733 aa  163  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  39.68 
 
 		 1000 aa  160  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  39.27 
 
 		 1022 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  39.84 
 
 		 1004 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  30.02 
 
 		 1094 aa  153  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.44 
 
 		 921 aa  153  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  40.24 
 
 		 1011 aa  153  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  37.65 
 
 		 1020 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  28.88 
 
 		 1142 aa  150  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  38.81 
 
 		 378 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  38.04 
 
 		 940 aa  150  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 621 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  39.75 
 
 		 950 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  40.73 
 
 		 1014 aa  148  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  38.02 
 
 		 453 aa  147  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  35.63 
 
 		 621 aa  146  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  40.96 
 
 		 1030 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.32 
 
 		 496 aa  145  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.84 
 
 		 631 aa  144  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  37.59 
 
 		 957 aa  143  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  38.15 
 
 		 1118 aa  143  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  31.74 
 
 		 388 aa  142  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  39.82 
 
 		 993 aa  142  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 268 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  38.96 
 
 		 1022 aa  141  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 1058 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  39.76 
 
 		 952 aa  140  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 622 aa  140  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  43.8 
 
 		 1072 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  36.84 
 
 		 981 aa  139  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  38.49 
 
 		 1055 aa  138  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  37.45 
 
 		 934 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 1003 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  39.27 
 
 		 1066 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  35.89 
 
 		 1010 aa  134  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 1093 aa  134  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 1048 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  36 
 
 		 252 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.15 
 
 		 1102 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  39.92 
 
 		 1110 aa  132  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  37.59 
 
 		 1005 aa  132  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  42.01 
 
 		 1161 aa  132  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  33.9 
 
 		 992 aa  131  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  34.41 
 
 		 261 aa  131  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1003 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  37.04 
 
 		 960 aa  130  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  32.26 
 
 		 267 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  36.11 
 
 		 921 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 969 aa  129  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  36.65 
 
 		 1123 aa  128  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  40.16 
 
 		 1186 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  34.66 
 
 		 990 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  33.68 
 
 		 946 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  34.82 
 
 		 965 aa  125  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  33.58 
 
 		 931 aa  125  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 489 aa  124  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  34.43 
 
 		 1021 aa  124  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  35.45 
 
 		 1699 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  34.67 
 
 		 907 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 1071 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  39.2 
 
 		 1092 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  36.95 
 
 		 1042 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.02 
 
 		 983 aa  122  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  35.55 
 
 		 655 aa  122  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  32.02 
 
 		 379 aa  122  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36 
 
 		 1125 aa  121  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 1100 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2444  SARP family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.467324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  34.34 
 
 		 1123 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.65 
 
 		 1103 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 1058 aa  120  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  34.4 
 
 		 370 aa  120  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  37.29 
 
 		 385 aa  119  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  36.8 
 
 		 1121 aa  118  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  35.77 
 
 		 1088 aa  118  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  37.9 
 
 		 1056 aa  118  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 268 aa  118  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  36.11 
 
 		 992 aa  117  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  36 
 
 		 1025 aa  117  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  37.75 
 
 		 1097 aa  117  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  34.41 
 
 		 262 aa  117  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  32.74 
 
 		 597 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  36.65 
 
 		 1048 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 602 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.6 
 
 		 1017 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  39.29 
 
 		 926 aa  116  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  35.8 
 
 		 954 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  35.5 
 
 		 943 aa  115  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  35.16 
 
 		 981 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  36.8 
 
 		 1114 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4209  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 		 271 aa  115  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  35.79 
 
 		 1071 aa  114  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  34.52 
 
 		 964 aa  114  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>