More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4191 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 621 aa  1250    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  36.56 
 
 		 990 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  33.5 
 
 		 1003 aa  250  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  36.08 
 
 		 950 aa  243  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  33.91 
 
 		 996 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  34.17 
 
 		 1022 aa  240  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  36.13 
 
 		 1030 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  34.93 
 
 		 1014 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  35.01 
 
 		 1088 aa  232  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  34.82 
 
 		 1010 aa  230  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.53 
 
 		 631 aa  230  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  34.07 
 
 		 995 aa  230  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  35.17 
 
 		 1021 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  33.53 
 
 		 621 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.53 
 
 		 496 aa  225  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  33.21 
 
 		 934 aa  223  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 654 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  35.47 
 
 		 946 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  33.65 
 
 		 992 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.42 
 
 		 1013 aa  220  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  32.44 
 
 		 983 aa  220  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  32.87 
 
 		 990 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  31.35 
 
 		 1022 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  36.99 
 
 		 965 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 1071 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  35.27 
 
 		 1020 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.2 
 
 		 931 aa  213  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.46 
 
 		 921 aa  213  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.89 
 
 		 981 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.58 
 
 		 964 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  30.46 
 
 		 1004 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  33.59 
 
 		 1025 aa  210  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  34.48 
 
 		 913 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  34.11 
 
 		 1033 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  35.05 
 
 		 1025 aa  206  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  32.88 
 
 		 981 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  32.97 
 
 		 940 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  34.29 
 
 		 1003 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  37.33 
 
 		 910 aa  203  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  31.76 
 
 		 956 aa  203  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  33.48 
 
 		 989 aa  203  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  32.62 
 
 		 971 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  28.83 
 
 		 1027 aa  200  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  36.35 
 
 		 1001 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  32.64 
 
 		 921 aa  198  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 1048 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  30.15 
 
 		 1011 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  34.2 
 
 		 910 aa  193  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  36.09 
 
 		 926 aa  193  8e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  33.11 
 
 		 1138 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  32.9 
 
 		 666 aa  190  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.09 
 
 		 1017 aa  190  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  28.67 
 
 		 1108 aa  190  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  31.68 
 
 		 928 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  33.82 
 
 		 962 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  35.37 
 
 		 963 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  33.4 
 
 		 954 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  31.93 
 
 		 941 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  32.46 
 
 		 919 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  35.84 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  31.12 
 
 		 907 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 622 aa  181  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  31.04 
 
 		 994 aa  180  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  29.84 
 
 		 612 aa  180  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  31.82 
 
 		 930 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  32.05 
 
 		 970 aa  176  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  32.2 
 
 		 1003 aa  174  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 1346 aa  173  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  31.71 
 
 		 928 aa  171  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  32.7 
 
 		 632 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  29.49 
 
 		 775 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  28.71 
 
 		 993 aa  167  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  31.86 
 
 		 992 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  32.13 
 
 		 915 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  29.75 
 
 		 1000 aa  165  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  29.89 
 
 		 935 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  32.79 
 
 		 967 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  32.75 
 
 		 960 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 1319 aa  161  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  30.3 
 
 		 993 aa  160  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  32.92 
 
 		 965 aa  160  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  31.94 
 
 		 1034 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  28.69 
 
 		 1030 aa  157  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  29.86 
 
 		 982 aa  157  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  29.7 
 
 		 1100 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  31.49 
 
 		 1008 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  30.8 
 
 		 908 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  31.58 
 
 		 1186 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  30.95 
 
 		 957 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  34.76 
 
 		 1024 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  36.43 
 
 		 378 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 968 aa  150  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 268 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  33.91 
 
 		 1102 aa  147  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  27.24 
 
 		 1054 aa  144  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  34.47 
 
 		 1092 aa  144  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  32.17 
 
 		 1123 aa  144  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  33.95 
 
 		 1125 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  29.98 
 
 		 582 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 370 aa  142  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>