More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1973 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1008 aa  1994    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  36.34 
 
 		 964 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  36.82 
 
 		 981 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  35.52 
 
 		 941 aa  392  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.12 
 
 		 1025 aa  365  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  33.2 
 
 		 996 aa  364  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  33.43 
 
 		 992 aa  360  7e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  35.3 
 
 		 1071 aa  337  5.999999999999999e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  40.38 
 
 		 990 aa  328  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  34.05 
 
 		 928 aa  326  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  33.45 
 
 		 913 aa  324  7e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.24 
 
 		 931 aa  323  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  33.97 
 
 		 962 aa  322  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  33.55 
 
 		 1034 aa  312  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  32.66 
 
 		 1020 aa  311  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  36.08 
 
 		 1030 aa  310  8e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  32.74 
 
 		 1010 aa  308  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.46 
 
 		 921 aa  308  5.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  35.72 
 
 		 967 aa  307  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  35.77 
 
 		 940 aa  307  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  32.46 
 
 		 919 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  40.64 
 
 		 1003 aa  305  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  31.77 
 
 		 934 aa  301  6e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  34.27 
 
 		 935 aa  300  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  30.61 
 
 		 1022 aa  300  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  33.84 
 
 		 993 aa  298  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  32.87 
 
 		 1088 aa  297  6e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  30.75 
 
 		 1014 aa  297  7e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  34.96 
 
 		 990 aa  293  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  32.55 
 
 		 921 aa  290  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  36.97 
 
 		 1030 aa  290  9e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  36.73 
 
 		 982 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  32.66 
 
 		 1138 aa  285  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  28.36 
 
 		 1027 aa  284  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  29.97 
 
 		 1017 aa  284  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  34.54 
 
 		 907 aa  282  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  36.44 
 
 		 992 aa  282  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.31 
 
 		 1108 aa  282  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 1048 aa  281  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  30.09 
 
 		 983 aa  273  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  28.9 
 
 		 995 aa  271  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  33.83 
 
 		 908 aa  270  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  36.32 
 
 		 930 aa  268  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  32.21 
 
 		 965 aa  265  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  32.53 
 
 		 1003 aa  264  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  30.23 
 
 		 1013 aa  261  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  35.59 
 
 		 788 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  30.45 
 
 		 946 aa  256  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  36.59 
 
 		 1025 aa  254  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  35.89 
 
 		 1024 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  33.1 
 
 		 956 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  32.08 
 
 		 971 aa  251  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  30.9 
 
 		 1021 aa  251  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  33.14 
 
 		 1001 aa  249  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  33.21 
 
 		 954 aa  250  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  36.81 
 
 		 963 aa  245  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  31.78 
 
 		 970 aa  244  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  29.82 
 
 		 993 aa  244  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 654 aa  244  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  31.73 
 
 		 928 aa  244  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  30.18 
 
 		 1011 aa  242  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  30.51 
 
 		 1022 aa  241  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  33.55 
 
 		 937 aa  240  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  34.7 
 
 		 989 aa  235  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 950 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 915 aa  233  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  33.76 
 
 		 775 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  35.06 
 
 		 1003 aa  231  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5351  hypothetical protein  40.95 
 
 		 862 aa  230  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  29.41 
 
 		 1033 aa  229  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  31.56 
 
 		 981 aa  227  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  35.82 
 
 		 790 aa  226  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  33.06 
 
 		 978 aa  224  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 		 755 aa  222  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  34.52 
 
 		 621 aa  221  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  36.17 
 
 		 926 aa  216  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 850 aa  214  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  31.13 
 
 		 1060 aa  211  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  32.24 
 
 		 915 aa  211  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  33.68 
 
 		 792 aa  211  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  34.18 
 
 		 797 aa  210  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 1319 aa  207  9e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 1346 aa  207  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  36.45 
 
 		 910 aa  207  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  33.39 
 
 		 1033 aa  204  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  34.23 
 
 		 582 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  37.1 
 
 		 965 aa  193  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  37.45 
 
 		 838 aa  193  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  37.35 
 
 		 453 aa  193  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.43 
 
 		 496 aa  190  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  29.55 
 
 		 741 aa  189  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  35.41 
 
 		 994 aa  188  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  34.24 
 
 		 715 aa  187  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1234  Tetratricopeptide TPR_4  40.51 
 
 		 832 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840453  decreased coverage  0.00091605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  29.08 
 
 		 978 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  31.78 
 
 		 910 aa  184  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  37.23 
 
 		 761 aa  184  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  30.29 
 
 		 782 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  30.74 
 
 		 792 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  34.91 
 
 		 806 aa  182  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>