183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1234 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1234  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 832 aa  1615    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840453  decreased coverage  0.00091605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  38.54 
 
 		 782 aa  243  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  39.64 
 
 		 992 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5351  hypothetical protein  40.78 
 
 		 862 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  37.37 
 
 		 964 aa  226  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  41.54 
 
 		 1008 aa  224  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  33.07 
 
 		 913 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  40.35 
 
 		 981 aa  221  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  35.57 
 
 		 931 aa  210  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  39.18 
 
 		 996 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  29.85 
 
 		 1017 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.43 
 
 		 962 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  43.48 
 
 		 1024 aa  201  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  36.7 
 
 		 941 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  36.61 
 
 		 1022 aa  194  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  33.33 
 
 		 788 aa  193  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  31.08 
 
 		 934 aa  191  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  34.51 
 
 		 1034 aa  187  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  36.4 
 
 		 919 aa  187  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  33.11 
 
 		 935 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  31.74 
 
 		 792 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  31.71 
 
 		 1003 aa  184  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  34.29 
 
 		 1138 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  31.5 
 
 		 992 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  38.36 
 
 		 963 aa  174  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  33.2 
 
 		 806 aa  172  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 850 aa  171  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  39.36 
 
 		 940 aa  171  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  33.02 
 
 		 1022 aa  170  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  38.01 
 
 		 783 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  32.5 
 
 		 970 aa  167  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 915 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  38.79 
 
 		 1108 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  40 
 
 		 990 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  41.51 
 
 		 612 aa  163  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  39.81 
 
 		 775 aa  163  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  30.52 
 
 		 946 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  34.25 
 
 		 834 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  36.05 
 
 		 1030 aa  161  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  29.07 
 
 		 1020 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 1071 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  41.16 
 
 		 1030 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  29.54 
 
 		 1010 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  28.48 
 
 		 1027 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  32.4 
 
 		 1025 aa  158  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  32.03 
 
 		 1011 aa  158  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  39.27 
 
 		 928 aa  157  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 741 aa  156  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  33.4 
 
 		 930 aa  156  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  38.46 
 
 		 1003 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  35.84 
 
 		 1014 aa  156  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  32.03 
 
 		 790 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  35.05 
 
 		 995 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  30.44 
 
 		 921 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  39.68 
 
 		 1025 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  35.96 
 
 		 908 aa  154  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  36.88 
 
 		 761 aa  153  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  36.03 
 
 		 1004 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  36.87 
 
 		 965 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  36.36 
 
 		 632 aa  150  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 654 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  39.44 
 
 		 971 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  32.36 
 
 		 993 aa  149  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  36.57 
 
 		 978 aa  147  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  29.04 
 
 		 993 aa  147  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  37.18 
 
 		 990 aa  146  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  29.12 
 
 		 814 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  30.36 
 
 		 1013 aa  145  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  34.65 
 
 		 937 aa  145  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  33.25 
 
 		 757 aa  143  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  32.53 
 
 		 797 aa  144  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  36.95 
 
 		 810 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 1048 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  33.24 
 
 		 907 aa  142  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  31.91 
 
 		 775 aa  141  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  33.58 
 
 		 1060 aa  140  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  34.24 
 
 		 838 aa  140  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  41.37 
 
 		 954 aa  140  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  41.32 
 
 		 1021 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  31.66 
 
 		 1088 aa  138  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 1319 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  34.16 
 
 		 715 aa  137  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  32.47 
 
 		 907 aa  134  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  33.68 
 
 		 792 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.22 
 
 		 950 aa  134  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.5 
 
 		 921 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  38.17 
 
 		 680 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  34.28 
 
 		 1003 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  32.89 
 
 		 967 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  29.04 
 
 		 1033 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  29.98 
 
 		 928 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  28.49 
 
 		 896 aa  129  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  37.94 
 
 		 582 aa  128  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  41.28 
 
 		 994 aa  128  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  36.89 
 
 		 978 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 755 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  32.13 
 
 		 1001 aa  126  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  33.67 
 
 		 915 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  35.1 
 
 		 1033 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  28.34 
 
 		 770 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>