More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1981 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1033 aa  2055    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  30.47 
 
 		 964 aa  296  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  29.36 
 
 		 941 aa  290  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  29.02 
 
 		 981 aa  288  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  30.09 
 
 		 990 aa  285  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  29.2 
 
 		 996 aa  284  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  30.19 
 
 		 919 aa  282  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  29.02 
 
 		 1025 aa  275  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  27.56 
 
 		 1108 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  29.7 
 
 		 1022 aa  262  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  28.07 
 
 		 946 aa  258  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  30.71 
 
 		 930 aa  256  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  29.56 
 
 		 921 aa  256  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  29.29 
 
 		 992 aa  254  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 		 962 aa  252  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 1071 aa  248  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  29.9 
 
 		 965 aa  247  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  27.49 
 
 		 1017 aa  244  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  29.38 
 
 		 992 aa  241  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 1048 aa  241  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  30.39 
 
 		 931 aa  239  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  30.31 
 
 		 928 aa  238  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  32.25 
 
 		 1008 aa  235  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  27.72 
 
 		 1020 aa  233  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  33.78 
 
 		 1014 aa  232  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  27.19 
 
 		 921 aa  232  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  27.87 
 
 		 1022 aa  227  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  28.88 
 
 		 1030 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  29.22 
 
 		 937 aa  227  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  29.77 
 
 		 956 aa  224  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  27.63 
 
 		 1003 aa  220  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  27.07 
 
 		 1034 aa  219  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  26.75 
 
 		 967 aa  218  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  28.14 
 
 		 993 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  35.1 
 
 		 1024 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  27.28 
 
 		 907 aa  213  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  33.24 
 
 		 1088 aa  212  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  34.21 
 
 		 1138 aa  212  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  29.01 
 
 		 934 aa  212  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  31.21 
 
 		 940 aa  212  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  31.81 
 
 		 995 aa  212  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  29.07 
 
 		 928 aa  211  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  26.77 
 
 		 913 aa  211  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  27.7 
 
 		 970 aa  211  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  30.95 
 
 		 935 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  32.93 
 
 		 963 aa  208  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  32.44 
 
 		 950 aa  207  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  29.03 
 
 		 783 aa  207  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  30.49 
 
 		 1030 aa  207  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  31.97 
 
 		 1003 aa  207  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  28.43 
 
 		 971 aa  207  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  28.28 
 
 		 908 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  28.54 
 
 		 981 aa  206  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  32.95 
 
 		 1010 aa  205  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  27.22 
 
 		 993 aa  206  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  31.3 
 
 		 621 aa  200  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  28.68 
 
 		 965 aa  197  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  34.37 
 
 		 1001 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  25.31 
 
 		 1027 aa  196  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  26.54 
 
 		 1060 aa  193  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  27.3 
 
 		 1021 aa  192  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  29.05 
 
 		 1054 aa  191  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  31.49 
 
 		 1025 aa  190  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  27.22 
 
 		 954 aa  189  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  27.39 
 
 		 1013 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 654 aa  188  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  28.93 
 
 		 788 aa  186  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  28.68 
 
 		 990 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  28.87 
 
 		 910 aa  178  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  30.72 
 
 		 1033 aa  177  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  29.79 
 
 		 983 aa  175  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  27.54 
 
 		 797 aa  174  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  29.14 
 
 		 775 aa  174  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  32.65 
 
 		 915 aa  171  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  26.39 
 
 		 1011 aa  171  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  28.15 
 
 		 978 aa  169  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  26.36 
 
 		 982 aa  168  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.11 
 
 		 496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 850 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  27.02 
 
 		 792 aa  165  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  28.6 
 
 		 612 aa  162  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  29.01 
 
 		 790 aa  162  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  30.03 
 
 		 989 aa  158  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  31.43 
 
 		 994 aa  157  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  30.05 
 
 		 632 aa  157  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30.62 
 
 		 631 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  29.04 
 
 		 1003 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 621 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  29.7 
 
 		 941 aa  152  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 1346 aa  152  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 814 aa  151  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  32.2 
 
 		 666 aa  150  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  28.55 
 
 		 622 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  32.53 
 
 		 582 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  36.01 
 
 		 370 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  33.11 
 
 		 453 aa  148  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  28.86 
 
 		 926 aa  147  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  31.3 
 
 		 782 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  26.89 
 
 		 770 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  25.88 
 
 		 834 aa  146  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>