More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4465 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 
1024 aa  1956    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  43.92 
 
 
1003 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  43.78 
 
 
1138 aa  436  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  40.46 
 
 
990 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  37.76 
 
 
992 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  34.21 
 
 
1022 aa  340  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  36.32 
 
 
654 aa  339  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  40.49 
 
 
963 aa  322  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  34.21 
 
 
996 aa  319  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  33.84 
 
 
934 aa  318  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 
981 aa  317  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  36.74 
 
 
1021 aa  317  8e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  38.9 
 
 
1108 aa  315  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  36.17 
 
 
971 aa  313  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  43.42 
 
 
1025 aa  303  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  42.52 
 
 
1088 aa  300  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  32.38 
 
 
941 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  34.82 
 
 
992 aa  283  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  41.32 
 
 
950 aa  282  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  43.78 
 
 
775 aa  282  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  42.35 
 
 
1030 aa  280  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  38.86 
 
 
1014 aa  280  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  32.14 
 
 
913 aa  279  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  42.78 
 
 
954 aa  278  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  42.26 
 
 
632 aa  278  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  38.57 
 
 
621 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  34.93 
 
 
1008 aa  273  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 
1017 aa  272  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  31.07 
 
 
964 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  41.89 
 
 
940 aa  271  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  30.37 
 
 
1027 aa  268  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  35.6 
 
 
910 aa  268  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.93 
 
 
921 aa  265  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  31.97 
 
 
1025 aa  265  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  32.55 
 
 
1022 aa  264  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  39.84 
 
 
612 aa  263  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  33.18 
 
 
1020 aa  260  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  33.14 
 
 
931 aa  259  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  42.37 
 
 
926 aa  258  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  31.77 
 
 
993 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.54 
 
 
1013 aa  255  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  40.98 
 
 
910 aa  254  8.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  38.33 
 
 
1010 aa  254  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  31.87 
 
 
946 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  34.7 
 
 
962 aa  252  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  32.8 
 
 
981 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  45.52 
 
 
965 aa  251  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  38.78 
 
 
1003 aa  250  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  36.01 
 
 
1071 aa  248  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  36.86 
 
 
1319 aa  248  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  37.88 
 
 
1033 aa  247  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  31.25 
 
 
1011 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  35.96 
 
 
995 aa  246  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  38.21 
 
 
1346 aa  246  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  35.69 
 
 
990 aa  241  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  33.76 
 
 
970 aa  240  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  33.94 
 
 
935 aa  237  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  32.48 
 
 
965 aa  237  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  35.15 
 
 
930 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  33.14 
 
 
937 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  31.65 
 
 
919 aa  232  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  33.24 
 
 
1003 aa  228  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  34.73 
 
 
1030 aa  227  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  36.78 
 
 
666 aa  225  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  43.6 
 
 
453 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  31.32 
 
 
1034 aa  223  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  41.3 
 
 
915 aa  222  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  32.58 
 
 
908 aa  221  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  30.65 
 
 
1048 aa  221  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  32.49 
 
 
928 aa  221  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
850 aa  220  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  39.49 
 
 
994 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  37.38 
 
 
622 aa  219  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  31.36 
 
 
921 aa  219  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  33.73 
 
 
928 aa  218  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  43.3 
 
 
788 aa  217  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  34.5 
 
 
907 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  32.44 
 
 
978 aa  214  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  36.42 
 
 
989 aa  210  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  37.52 
 
 
1054 aa  208  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  38.33 
 
 
1001 aa  208  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  32.59 
 
 
783 aa  207  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  40.29 
 
 
896 aa  206  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  32.99 
 
 
983 aa  204  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  34.68 
 
 
797 aa  203  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  39.36 
 
 
496 aa  200  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  31.59 
 
 
1033 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.32 
 
 
631 aa  198  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  35.6 
 
 
956 aa  197  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  40.88 
 
 
761 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
755 aa  195  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  40.3 
 
 
715 aa  193  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  34.58 
 
 
915 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  34.38 
 
 
967 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 
806 aa  188  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  34.08 
 
 
982 aa  187  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  41.95 
 
 
814 aa  187  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
810 aa  185  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  35.15 
 
 
792 aa  185  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  37.22 
 
 
582 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>