More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3384 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1020 aa  2024    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  35.78 
 
 		 1088 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 1048 aa  458  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  36.2 
 
 		 981 aa  456  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  34.8 
 
 		 1022 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  37.23 
 
 		 931 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  32.8 
 
 		 1025 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  35.62 
 
 		 1030 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.83 
 
 		 921 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  42.77 
 
 		 1014 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  32.02 
 
 		 1027 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  35.84 
 
 		 993 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  34.97 
 
 		 941 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  32.89 
 
 		 1108 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 1071 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  38.05 
 
 		 965 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  35.96 
 
 		 940 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  33.56 
 
 		 919 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  33.81 
 
 		 913 aa  389  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  33.97 
 
 		 1003 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  32.97 
 
 		 990 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  32.54 
 
 		 1010 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  34.13 
 
 		 970 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  32.49 
 
 		 992 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  31.59 
 
 		 1022 aa  376  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  33.43 
 
 		 946 aa  376  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  32.97 
 
 		 1054 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  34.63 
 
 		 965 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  37.05 
 
 		 788 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.63 
 
 		 1017 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  34.86 
 
 		 928 aa  365  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  33.64 
 
 		 992 aa  363  8e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  32.07 
 
 		 990 aa  362  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  31.89 
 
 		 1003 aa  360  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.95 
 
 		 950 aa  360  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  32.24 
 
 		 1011 aa  360  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  32.25 
 
 		 993 aa  360  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  37.02 
 
 		 995 aa  359  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  33.08 
 
 		 934 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  30.3 
 
 		 996 aa  358  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  40.03 
 
 		 989 aa  358  3.9999999999999996e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  32.13 
 
 		 1033 aa  356  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  33.2 
 
 		 1021 aa  351  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.6 
 
 		 964 aa  347  8e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  32.07 
 
 		 962 aa  344  5e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  32.41 
 
 		 908 aa  340  7e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  31.94 
 
 		 956 aa  338  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  32.33 
 
 		 1034 aa  338  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  30.89 
 
 		 982 aa  334  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  32.94 
 
 		 921 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 915 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  31.02 
 
 		 930 aa  332  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  33.04 
 
 		 1008 aa  330  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  31.37 
 
 		 967 aa  328  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 954 aa  327  9e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 		 850 aa  325  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  32.75 
 
 		 1013 aa  323  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  31.58 
 
 		 971 aa  322  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 654 aa  321  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  33.85 
 
 		 790 aa  319  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  33.37 
 
 		 1003 aa  318  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  31.4 
 
 		 907 aa  318  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  36.46 
 
 		 983 aa  317  9e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  31.27 
 
 		 928 aa  311  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  32.99 
 
 		 1001 aa  305  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  31.85 
 
 		 1030 aa  302  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  34.3 
 
 		 797 aa  303  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  33.52 
 
 		 935 aa  301  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 755 aa  300  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  36.04 
 
 		 838 aa  298  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  32.32 
 
 		 937 aa  292  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  32.51 
 
 		 978 aa  290  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  35.23 
 
 		 621 aa  289  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  30.75 
 
 		 981 aa  286  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  32.62 
 
 		 775 aa  284  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 1319 aa  276  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  33.54 
 
 		 715 aa  275  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  39.23 
 
 		 496 aa  273  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 		 775 aa  272  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  31.83 
 
 		 1138 aa  271  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  30.88 
 
 		 963 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  40.98 
 
 		 453 aa  265  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  30.3 
 
 		 741 aa  261  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  32.25 
 
 		 792 aa  260  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  32.33 
 
 		 1024 aa  254  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 1346 aa  251  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.1 
 
 		 742 aa  249  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  32.55 
 
 		 910 aa  245  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  33.05 
 
 		 814 aa  242  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  37.79 
 
 		 926 aa  241  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  36.24 
 
 		 632 aa  240  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  35.42 
 
 		 666 aa  240  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 907 aa  238  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 621 aa  233  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 806 aa  231  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  33.82 
 
 		 612 aa  231  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  35.3 
 
 		 910 aa  226  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  37.82 
 
 		 582 aa  225  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  29.87 
 
 		 783 aa  225  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  29.02 
 
 		 834 aa  222  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>