More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6221 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 931 aa  1806    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  39.05 
 
 		 940 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  37.28 
 
 		 981 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  35.86 
 
 		 930 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  36.81 
 
 		 1020 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  36.11 
 
 		 970 aa  406  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 1071 aa  403  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  39.93 
 
 		 1088 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  39.92 
 
 		 965 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  36.7 
 
 		 921 aa  382  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  35.95 
 
 		 965 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 1048 aa  379  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  36.34 
 
 		 990 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  36.1 
 
 		 941 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 		 919 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  33.67 
 
 		 1108 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  33.83 
 
 		 934 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  37.16 
 
 		 996 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.44 
 
 		 921 aa  366  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  33.8 
 
 		 1022 aa  365  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  36.05 
 
 		 928 aa  364  5.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  33.81 
 
 		 913 aa  360  9e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  34.81 
 
 		 992 aa  356  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  36.54 
 
 		 1010 aa  355  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.62 
 
 		 1025 aa  353  8.999999999999999e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  32.34 
 
 		 1017 aa  351  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  31.65 
 
 		 1027 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  34.26 
 
 		 946 aa  347  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  36.91 
 
 		 1030 aa  346  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  36.08 
 
 		 950 aa  346  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  33.77 
 
 		 928 aa  344  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  32.74 
 
 		 967 aa  343  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  34.46 
 
 		 990 aa  341  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  32.52 
 
 		 907 aa  339  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  38.66 
 
 		 788 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  33.27 
 
 		 1021 aa  335  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  35.17 
 
 		 908 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  35.53 
 
 		 1054 aa  332  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  34.81 
 
 		 1014 aa  331  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  33.43 
 
 		 1011 aa  329  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  39.97 
 
 		 995 aa  328  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  32.02 
 
 		 1003 aa  326  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  38.48 
 
 		 790 aa  325  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  34 
 
 		 937 aa  324  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 654 aa  324  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  34.47 
 
 		 1008 aa  323  9.000000000000001e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  32.21 
 
 		 1034 aa  320  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  35.59 
 
 		 797 aa  315  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  32.85 
 
 		 993 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  32.95 
 
 		 954 aa  308  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  32.92 
 
 		 971 aa  307  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  33.3 
 
 		 964 aa  307  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  32.24 
 
 		 992 aa  301  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  32.06 
 
 		 956 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  33.44 
 
 		 1003 aa  297  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  34.8 
 
 		 1003 aa  296  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  36.94 
 
 		 989 aa  293  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  34.38 
 
 		 1033 aa  292  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  32.38 
 
 		 1022 aa  291  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  37.99 
 
 		 1025 aa  291  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  37.21 
 
 		 915 aa  290  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  35.16 
 
 		 983 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  37.13 
 
 		 850 aa  288  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.02 
 
 		 1013 aa  287  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  36.24 
 
 		 775 aa  287  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  32.32 
 
 		 962 aa  284  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  33.68 
 
 		 806 aa  282  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  33.66 
 
 		 935 aa  280  9e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  36.96 
 
 		 993 aa  280  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  35.99 
 
 		 982 aa  277  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  34.24 
 
 		 1001 aa  277  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  33.51 
 
 		 978 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  38.91 
 
 		 963 aa  274  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  34.32 
 
 		 814 aa  270  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 		 775 aa  265  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  35.39 
 
 		 1030 aa  263  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  31.42 
 
 		 981 aa  263  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  38.7 
 
 		 496 aa  263  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  41.13 
 
 		 582 aa  263  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  37.96 
 
 		 838 aa  263  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  33.62 
 
 		 910 aa  262  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 755 aa  260  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  35.18 
 
 		 792 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  35.05 
 
 		 715 aa  258  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  36.04 
 
 		 1004 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 1346 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  38.02 
 
 		 1138 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  34.98 
 
 		 915 aa  252  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  36.59 
 
 		 621 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  37.2 
 
 		 910 aa  247  9e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  39.86 
 
 		 453 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 1319 aa  245  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  37.66 
 
 		 612 aa  244  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.99 
 
 		 631 aa  240  8e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  31.76 
 
 		 994 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  36.41 
 
 		 632 aa  235  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1024 aa  235  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  33.37 
 
 		 926 aa  231  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  30.64 
 
 		 783 aa  224  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  31.86 
 
 		 757 aa  223  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>