More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6515 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1004 aa  1961    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  63.06 
 
 		 1011 aa  1098    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  35.06 
 
 		 940 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  34.27 
 
 		 1020 aa  359  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  33.55 
 
 		 1022 aa  359  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  32.21 
 
 		 921 aa  350  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  35.87 
 
 		 965 aa  346  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  32.9 
 
 		 993 aa  345  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.02 
 
 		 931 aa  343  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  31.66 
 
 		 946 aa  333  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  30.47 
 
 		 1027 aa  326  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  30.44 
 
 		 1017 aa  326  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.97 
 
 		 921 aa  324  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 1048 aa  320  7e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  32.78 
 
 		 990 aa  318  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 1071 aa  317  9e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  31.97 
 
 		 1108 aa  315  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  32.14 
 
 		 1003 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  32.36 
 
 		 981 aa  313  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  31.74 
 
 		 1022 aa  312  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  36.26 
 
 		 1030 aa  310  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  32.01 
 
 		 1025 aa  308  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  36.57 
 
 		 1010 aa  308  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1088 aa  308  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  30.94 
 
 		 990 aa  306  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  31.24 
 
 		 996 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  30.32 
 
 		 930 aa  302  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  33.3 
 
 		 954 aa  300  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  32.34 
 
 		 1003 aa  299  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  31.51 
 
 		 919 aa  297  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  31.11 
 
 		 982 aa  296  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  31.96 
 
 		 928 aa  295  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  34.32 
 
 		 995 aa  295  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  32.78 
 
 		 908 aa  293  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  32.64 
 
 		 913 aa  292  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  35.36 
 
 		 983 aa  290  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  31.52 
 
 		 941 aa  290  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  30.03 
 
 		 934 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  31.65 
 
 		 907 aa  283  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  30.68 
 
 		 970 aa  283  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  34 
 
 		 992 aa  280  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  30.9 
 
 		 928 aa  277  9e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  31.54 
 
 		 1021 aa  274  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  31.09 
 
 		 964 aa  273  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  31.29 
 
 		 981 aa  271  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  31.38 
 
 		 992 aa  270  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  33.43 
 
 		 621 aa  268  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  30.01 
 
 		 956 aa  267  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  31.65 
 
 		 937 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  36.54 
 
 		 1001 aa  260  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  30.84 
 
 		 993 aa  258  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  34.27 
 
 		 788 aa  255  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 654 aa  250  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.92 
 
 		 496 aa  248  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  30.32 
 
 		 1008 aa  245  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  29.69 
 
 		 971 aa  245  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  29.46 
 
 		 1003 aa  244  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  36.62 
 
 		 790 aa  240  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  30.41 
 
 		 1013 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  34.48 
 
 		 715 aa  238  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  35.49 
 
 		 1138 aa  234  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 850 aa  228  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  30.29 
 
 		 1030 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  33.11 
 
 		 989 aa  226  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  34.63 
 
 		 797 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  29.38 
 
 		 1054 aa  224  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  31.38 
 
 		 1014 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  32.82 
 
 		 792 aa  221  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  31.62 
 
 		 910 aa  218  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  33.43 
 
 		 838 aa  217  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  32.04 
 
 		 965 aa  214  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  31.49 
 
 		 1034 aa  214  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 621 aa  213  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  31.72 
 
 		 806 aa  212  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 755 aa  211  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 915 aa  210  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 622 aa  207  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  34.4 
 
 		 814 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.83 
 
 		 631 aa  205  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  39.89 
 
 		 1033 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  32.45 
 
 		 775 aa  200  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  30.62 
 
 		 1024 aa  198  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  29.7 
 
 		 926 aa  198  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  33.33 
 
 		 690 aa  195  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  30.41 
 
 		 775 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  32.19 
 
 		 612 aa  192  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  34.12 
 
 		 632 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  36.95 
 
 		 370 aa  188  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  33.28 
 
 		 666 aa  181  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  31.39 
 
 		 715 aa  179  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.88 
 
 		 742 aa  178  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  29.77 
 
 		 910 aa  178  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  29 
 
 		 741 aa  178  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  30.9 
 
 		 1025 aa  177  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  29.05 
 
 		 915 aa  175  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  32.27 
 
 		 935 aa  174  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  32.6 
 
 		 978 aa  172  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.38 
 
 		 962 aa  172  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  33.79 
 
 		 757 aa  172  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  32.59 
 
 		 687 aa  169  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>