More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3744 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 814 aa  1605    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  42.98 
 
 		 928 aa  462  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  39.55 
 
 		 930 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.46 
 
 		 742 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  42.22 
 
 		 838 aa  422  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  41.26 
 
 		 806 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 775 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 907 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  38.07 
 
 		 921 aa  392  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  39.66 
 
 		 965 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  38.77 
 
 		 946 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  39.01 
 
 		 967 aa  359  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  35.74 
 
 		 919 aa  337  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  33.24 
 
 		 757 aa  334  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  37.23 
 
 		 908 aa  333  7.000000000000001e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  36.5 
 
 		 993 aa  327  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  38.65 
 
 		 928 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  38.51 
 
 		 687 aa  318  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  35.89 
 
 		 970 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  34.58 
 
 		 941 aa  299  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  34.58 
 
 		 956 aa  293  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.32 
 
 		 931 aa  282  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  32.69 
 
 		 1025 aa  276  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  35.04 
 
 		 788 aa  274  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  33.28 
 
 		 850 aa  274  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  32.84 
 
 		 790 aa  270  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  34.29 
 
 		 797 aa  258  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 915 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  34.18 
 
 		 937 aa  251  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  31.65 
 
 		 913 aa  244  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.66 
 
 		 964 aa  241  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  33.43 
 
 		 1011 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  38.04 
 
 		 715 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  32.76 
 
 		 1020 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  42.9 
 
 		 1033 aa  238  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 755 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  32.92 
 
 		 962 aa  234  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  41.32 
 
 		 990 aa  233  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  32.31 
 
 		 1003 aa  233  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.52 
 
 		 996 aa  233  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  33.09 
 
 		 981 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  31.86 
 
 		 1088 aa  231  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 1048 aa  227  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  35.22 
 
 		 792 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1666  transcriptional regulator, XRE family  40.13 
 
 		 462 aa  226  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  34.84 
 
 		 995 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  44.21 
 
 		 1014 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  43.82 
 
 		 1001 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  29.87 
 
 		 1027 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  41.88 
 
 		 1010 aa  219  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  33.78 
 
 		 783 aa  218  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  31.08 
 
 		 934 aa  217  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  32.47 
 
 		 1054 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  35.24 
 
 		 978 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 992 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  41.86 
 
 		 990 aa  213  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  32.43 
 
 		 954 aa  212  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  41.89 
 
 		 1003 aa  213  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  34.63 
 
 		 1004 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 1071 aa  211  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  29.76 
 
 		 1017 aa  209  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.55 
 
 		 921 aa  209  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  34.05 
 
 		 1021 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  32.26 
 
 		 992 aa  205  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  32.73 
 
 		 1022 aa  201  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  37.25 
 
 		 1030 aa  200  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 		 1108 aa  200  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  34.76 
 
 		 965 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  29.58 
 
 		 1022 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  39.76 
 
 		 1024 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  30.64 
 
 		 940 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  37.6 
 
 		 1003 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  31.34 
 
 		 993 aa  190  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  30.56 
 
 		 1138 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  32.52 
 
 		 741 aa  188  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  40.59 
 
 		 963 aa  187  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  33.28 
 
 		 1013 aa  187  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  39.86 
 
 		 632 aa  184  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  31.91 
 
 		 941 aa  183  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  34.54 
 
 		 775 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  32.99 
 
 		 1008 aa  181  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  30.03 
 
 		 1034 aa  180  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.91 
 
 		 983 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5351  hypothetical protein  33.17 
 
 		 862 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 654 aa  178  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  29.48 
 
 		 971 aa  177  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  34.85 
 
 		 1025 aa  176  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  31.2 
 
 		 810 aa  174  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  31.75 
 
 		 982 aa  174  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  30.06 
 
 		 770 aa  174  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  32.05 
 
 		 935 aa  173  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  31.22 
 
 		 950 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  30.83 
 
 		 715 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 907 aa  171  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  32.7 
 
 		 792 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  31.2 
 
 		 896 aa  168  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  33.54 
 
 		 761 aa  168  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  31.62 
 
 		 981 aa  168  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  31.82 
 
 		 690 aa  163  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  34.44 
 
 		 989 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>