More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3391 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 971 aa  1910    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  72.85 
 
 		 1021 aa  1305    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  36.39 
 
 		 1022 aa  512  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  34.05 
 
 		 1108 aa  418  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  35.5 
 
 		 954 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  37.3 
 
 		 950 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 654 aa  396  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.06 
 
 		 981 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  39.3 
 
 		 775 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  34.71 
 
 		 992 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  33.81 
 
 		 990 aa  358  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  32.17 
 
 		 941 aa  347  7e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  33.84 
 
 		 1003 aa  347  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  35.65 
 
 		 940 aa  346  8.999999999999999e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  32.67 
 
 		 992 aa  342  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  34.62 
 
 		 1025 aa  339  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  30.22 
 
 		 996 aa  331  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  32.82 
 
 		 1025 aa  325  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  34.53 
 
 		 1088 aa  325  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  31.16 
 
 		 946 aa  323  8e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  33.7 
 
 		 1013 aa  319  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  31.39 
 
 		 934 aa  318  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  32.67 
 
 		 931 aa  316  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 1346 aa  312  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  31.06 
 
 		 1020 aa  311  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  32.05 
 
 		 919 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  31.93 
 
 		 913 aa  308  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.42 
 
 		 921 aa  306  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  36.42 
 
 		 621 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 1048 aa  299  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  31.82 
 
 		 970 aa  294  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 1071 aa  293  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  38.22 
 
 		 1138 aa  292  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 		 963 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  30.66 
 
 		 1022 aa  288  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 1319 aa  287  5e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  32.41 
 
 		 956 aa  287  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  31.69 
 
 		 965 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  32.1 
 
 		 993 aa  285  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.48 
 
 		 962 aa  283  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  28.24 
 
 		 1017 aa  283  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  42.74 
 
 		 1024 aa  281  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  31.97 
 
 		 921 aa  279  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  37.07 
 
 		 612 aa  275  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  41.42 
 
 		 994 aa  271  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  36.69 
 
 		 990 aa  269  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  32.31 
 
 		 788 aa  264  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  35.16 
 
 		 1030 aa  262  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  30.45 
 
 		 1054 aa  262  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  29.03 
 
 		 930 aa  262  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  31.63 
 
 		 935 aa  261  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  36.58 
 
 		 1003 aa  258  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  32.09 
 
 		 1008 aa  257  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  31.56 
 
 		 1014 aa  255  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  32.09 
 
 		 965 aa  253  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  31.64 
 
 		 1010 aa  253  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  29.74 
 
 		 928 aa  251  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  37.48 
 
 		 910 aa  249  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  40.89 
 
 		 453 aa  249  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  30.52 
 
 		 908 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  29.77 
 
 		 981 aa  248  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  38.64 
 
 		 1033 aa  248  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  30.77 
 
 		 964 aa  248  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  37.01 
 
 		 915 aa  247  6e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  34.89 
 
 		 666 aa  246  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  34.58 
 
 		 989 aa  243  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  36.85 
 
 		 632 aa  242  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 850 aa  241  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  35.29 
 
 		 983 aa  241  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  28.54 
 
 		 1011 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  28.2 
 
 		 1027 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  31.86 
 
 		 790 aa  239  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  37.42 
 
 		 926 aa  236  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  31.42 
 
 		 937 aa  234  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  34.94 
 
 		 995 aa  234  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  32.08 
 
 		 907 aa  233  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  29.3 
 
 		 967 aa  233  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  32.97 
 
 		 1001 aa  230  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  28.9 
 
 		 928 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  38.51 
 
 		 910 aa  226  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  33.86 
 
 		 1034 aa  219  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  30.3 
 
 		 797 aa  217  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 621 aa  217  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  36.52 
 
 		 582 aa  216  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  32.35 
 
 		 792 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.65 
 
 		 496 aa  213  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6871  hypothetical protein  28.63 
 
 		 854 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 		 1003 aa  211  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 		 915 aa  207  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  29.67 
 
 		 993 aa  207  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  29.2 
 
 		 978 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  31.64 
 
 		 755 aa  201  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  29.39 
 
 		 941 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 622 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  30.59 
 
 		 978 aa  197  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  30.67 
 
 		 715 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  27.19 
 
 		 982 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  32.21 
 
 		 1030 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 		 896 aa  184  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30.76 
 
 		 631 aa  183  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>