More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5280 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 632 aa  1227    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  41.33 
 
 		 990 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 654 aa  362  8e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 621 aa  334  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  38.2 
 
 		 992 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  36.68 
 
 		 981 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  40.39 
 
 		 1088 aa  329  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  41.56 
 
 		 1138 aa  328  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  39.71 
 
 		 1003 aa  326  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  35.56 
 
 		 1022 aa  323  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  37.94 
 
 		 993 aa  323  8e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  39.34 
 
 		 1025 aa  318  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  37.23 
 
 		 934 aa  313  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  38.39 
 
 		 1030 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  35.11 
 
 		 1017 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  39.37 
 
 		 1021 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.88 
 
 		 950 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  35.25 
 
 		 1108 aa  303  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  37.74 
 
 		 954 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  35.41 
 
 		 996 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  41.7 
 
 		 1024 aa  297  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  35.34 
 
 		 1014 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  37.97 
 
 		 970 aa  294  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  36.32 
 
 		 962 aa  293  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  37.87 
 
 		 1034 aa  292  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 1071 aa  290  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  36.94 
 
 		 941 aa  290  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  37.46 
 
 		 931 aa  287  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.48 
 
 		 921 aa  286  7e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  37.94 
 
 		 963 aa  284  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  35.15 
 
 		 1022 aa  283  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  37 
 
 		 940 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  37.32 
 
 		 1025 aa  279  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  35.13 
 
 		 964 aa  279  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  35.95 
 
 		 990 aa  279  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  36.57 
 
 		 992 aa  277  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  36.99 
 
 		 956 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  36.24 
 
 		 1020 aa  273  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  37.18 
 
 		 971 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  36.19 
 
 		 775 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  36.45 
 
 		 946 aa  272  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  41.18 
 
 		 994 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  36.76 
 
 		 935 aa  267  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  32.84 
 
 		 1027 aa  266  8.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  34.51 
 
 		 1003 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  33.93 
 
 		 930 aa  259  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  39.4 
 
 		 453 aa  259  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  35.67 
 
 		 921 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  35.26 
 
 		 919 aa  252  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  32.31 
 
 		 995 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  35.22 
 
 		 937 aa  251  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  33.99 
 
 		 913 aa  250  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.78 
 
 		 1013 aa  250  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 1048 aa  250  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  34.73 
 
 		 612 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  33.28 
 
 		 1010 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.75 
 
 		 989 aa  247  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  36.17 
 
 		 1001 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  38.06 
 
 		 496 aa  243  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  36.53 
 
 		 910 aa  239  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 1319 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  33.44 
 
 		 1033 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  36.03 
 
 		 926 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  32.99 
 
 		 1011 aa  234  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  32.68 
 
 		 983 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  33.5 
 
 		 666 aa  229  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  35.66 
 
 		 965 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  34.01 
 
 		 1030 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 1346 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  36.16 
 
 		 910 aa  228  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 		 907 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.22 
 
 		 631 aa  226  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 622 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  35.68 
 
 		 1054 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  33.59 
 
 		 928 aa  221  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  32.79 
 
 		 1003 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  36.23 
 
 		 928 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  33.39 
 
 		 908 aa  216  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 621 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  35.34 
 
 		 965 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  31.61 
 
 		 967 aa  212  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  35.82 
 
 		 915 aa  209  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  33.88 
 
 		 582 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  40.36 
 
 		 960 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  31.87 
 
 		 1008 aa  190  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  30.78 
 
 		 981 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  30.52 
 
 		 982 aa  183  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  42.67 
 
 		 378 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  36.07 
 
 		 788 aa  181  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  28.96 
 
 		 993 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  36.62 
 
 		 783 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  34.95 
 
 		 915 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  39.12 
 
 		 810 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  37.67 
 
 		 838 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  35.65 
 
 		 790 aa  171  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  31.36 
 
 		 1033 aa  170  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  35.52 
 
 		 806 aa  168  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  35.43 
 
 		 797 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  35.24 
 
 		 757 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  36.51 
 
 		 978 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>