More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6027 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  100 
 
 		 960 aa  1885    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  45.45 
 
 		 792 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 957 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  38.65 
 
 		 1125 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  42.58 
 
 		 1102 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  39.94 
 
 		 701 aa  439  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 814 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  41.63 
 
 		 1092 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  39.05 
 
 		 1017 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  37.05 
 
 		 952 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 775 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 1100 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  42.9 
 
 		 1056 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  40.3 
 
 		 1103 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 1058 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  40.29 
 
 		 1093 aa  395  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  40.42 
 
 		 840 aa  389  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  41.55 
 
 		 1087 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  40.46 
 
 		 1066 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  42.65 
 
 		 1110 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  40.26 
 
 		 678 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  41.51 
 
 		 1050 aa  379  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  67.99 
 
 		 378 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  39.22 
 
 		 776 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  41.76 
 
 		 1055 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  38.88 
 
 		 1042 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  39.84 
 
 		 1043 aa  372  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.69 
 
 		 969 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  40.3 
 
 		 1058 aa  358  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  37.04 
 
 		 1097 aa  353  5.9999999999999994e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 781 aa  350  6e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  40.78 
 
 		 755 aa  349  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  41.16 
 
 		 1072 aa  348  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 1082 aa  347  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  37.3 
 
 		 943 aa  347  6e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  37.06 
 
 		 1049 aa  341  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  38.25 
 
 		 1158 aa  340  8e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  40.32 
 
 		 1060 aa  334  6e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  37.8 
 
 		 1005 aa  333  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  40.38 
 
 		 1085 aa  330  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  39.06 
 
 		 1036 aa  327  8.000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 765 aa  323  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.23 
 
 		 999 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  44.65 
 
 		 760 aa  320  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  37.71 
 
 		 780 aa  318  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  33.84 
 
 		 943 aa  317  8e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  45.01 
 
 		 1137 aa  316  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  39.41 
 
 		 1048 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  35.34 
 
 		 1018 aa  309  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  40.11 
 
 		 1094 aa  308  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 1186 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 1028 aa  293  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  40.41 
 
 		 824 aa  293  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  29.53 
 
 		 816 aa  290  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  37.09 
 
 		 980 aa  289  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  38.24 
 
 		 644 aa  287  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  47.28 
 
 		 1227 aa  287  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  41.32 
 
 		 818 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  42.32 
 
 		 1119 aa  279  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 882 aa  278  5e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  36.66 
 
 		 963 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  38.44 
 
 		 1005 aa  273  9e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  33.69 
 
 		 941 aa  273  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  43.68 
 
 		 887 aa  269  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  36.94 
 
 		 886 aa  267  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1065  ATPase-like protein  35.1 
 
 		 649 aa  266  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.444255  normal  0.509031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  36.83 
 
 		 922 aa  264  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  32.39 
 
 		 777 aa  264  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 1027 aa  251  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  40.99 
 
 		 799 aa  250  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 877 aa  248  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  35.53 
 
 		 921 aa  248  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  35.27 
 
 		 972 aa  245  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  40.4 
 
 		 916 aa  245  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  35.08 
 
 		 768 aa  243  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 393 aa  243  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  35.26 
 
 		 1064 aa  241  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 901 aa  241  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.81 
 
 		 981 aa  240  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 601 aa  239  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 966 aa  238  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 601 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 601 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  37.03 
 
 		 961 aa  232  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  36.6 
 
 		 1088 aa  232  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  36.2 
 
 		 1100 aa  232  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  38.55 
 
 		 992 aa  230  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  38.15 
 
 		 591 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  36.9 
 
 		 940 aa  229  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 		 1010 aa  228  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 888 aa  229  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  39.01 
 
 		 591 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.85 
 
 		 921 aa  228  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  33.21 
 
 		 928 aa  228  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  36.55 
 
 		 621 aa  226  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  34.38 
 
 		 827 aa  225  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  42.64 
 
 		 919 aa  225  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  36.4 
 
 		 1141 aa  223  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  37.67 
 
 		 779 aa  222  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  38.32 
 
 		 907 aa  222  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>