254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1211 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 378 aa  729    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  67.99 
 
 		 960 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  45.13 
 
 		 940 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  49.83 
 
 		 1088 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  46.2 
 
 		 992 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  46.9 
 
 		 950 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  42.96 
 
 		 981 aa  195  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  43.83 
 
 		 1000 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  44.12 
 
 		 989 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  42.76 
 
 		 496 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  42.67 
 
 		 1025 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  40.13 
 
 		 621 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  40.86 
 
 		 1102 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  40.12 
 
 		 921 aa  182  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  37.91 
 
 		 1022 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  43.38 
 
 		 1092 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  41.86 
 
 		 990 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 622 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  44.19 
 
 		 1733 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  40.86 
 
 		 928 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  40.74 
 
 		 1010 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 1071 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  40.76 
 
 		 1014 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  38.19 
 
 		 996 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 1158 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 760 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  43.2 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  41.83 
 
 		 267 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  44.23 
 
 		 1110 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  40.52 
 
 		 1020 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  40.13 
 
 		 952 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  40.59 
 
 		 1100 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  43.8 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  42.76 
 
 		 1125 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  40.27 
 
 		 919 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 654 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  40.15 
 
 		 278 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  41.02 
 
 		 921 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  43.1 
 
 		 954 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  38.08 
 
 		 1003 aa  166  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4209  transcriptional regulator, SARP family  42.86 
 
 		 271 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  38.71 
 
 		 1108 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  41.39 
 
 		 957 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  40.26 
 
 		 1186 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  37.71 
 
 		 946 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  41 
 
 		 1013 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  40.49 
 
 		 1699 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  45.23 
 
 		 1021 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  42 
 
 		 1072 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 979 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  39.6 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  40.13 
 
 		 1103 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  40.24 
 
 		 833 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  41.31 
 
 		 1123 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  44.86 
 
 		 1005 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  38.8 
 
 		 931 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  39.53 
 
 		 631 aa  153  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  42.67 
 
 		 1056 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 1028 aa  152  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  41.28 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  40.49 
 
 		 956 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 968 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  44.72 
 
 		 1055 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 621 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  41.63 
 
 		 1339 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  35.47 
 
 		 1017 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  40.4 
 
 		 1017 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  40.5 
 
 		 597 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  38.28 
 
 		 943 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  39.75 
 
 		 1003 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  37.37 
 
 		 995 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  37.89 
 
 		 1030 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  38.51 
 
 		 1030 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  40.49 
 
 		 252 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  39.69 
 
 		 965 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 276 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  34.75 
 
 		 1027 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  38.31 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  37.54 
 
 		 990 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  38 
 
 		 930 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.4 
 
 		 1058 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  37.71 
 
 		 962 aa  143  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  39.86 
 
 		 935 aa  143  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  36.82 
 
 		 934 aa  143  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  42.86 
 
 		 926 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4955  SARP family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 292 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  42.23 
 
 		 1048 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  37.12 
 
 		 1093 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 602 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  36.39 
 
 		 1043 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  38.33 
 
 		 941 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  44.35 
 
 		 937 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  37.07 
 
 		 1141 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  36.42 
 
 		 983 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  35.18 
 
 		 981 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 297 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  37.54 
 
 		 964 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  41.06 
 
 		 963 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>