More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5783 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 
1021 aa  1993    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  72.85 
 
 
971 aa  1325    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  36.59 
 
 
1022 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  36.49 
 
 
1108 aa  462  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  37.67 
 
 
954 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  37.23 
 
 
950 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  35.09 
 
 
981 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  35.66 
 
 
992 aa  416  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  35.94 
 
 
990 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  41.97 
 
 
654 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  38.28 
 
 
775 aa  373  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  35.57 
 
 
1025 aa  363  8e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  33.57 
 
 
1346 aa  359  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  36.04 
 
 
940 aa  357  8.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  34.51 
 
 
1003 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  33.27 
 
 
931 aa  353  7e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.1 
 
 
996 aa  347  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  33.08 
 
 
992 aa  342  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  33.02 
 
 
941 aa  340  9e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  32.93 
 
 
1020 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  32.04 
 
 
946 aa  337  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  34.54 
 
 
1088 aa  334  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.13 
 
 
1013 aa  329  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  31.41 
 
 
1071 aa  323  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  32.91 
 
 
919 aa  321  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  34.04 
 
 
1138 aa  320  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  32.67 
 
 
1025 aa  319  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  32.3 
 
 
1048 aa  318  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  37.74 
 
 
1319 aa  318  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.54 
 
 
921 aa  317  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  36.21 
 
 
621 aa  313  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  30.95 
 
 
934 aa  311  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  32.46 
 
 
970 aa  307  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  29.81 
 
 
1017 aa  307  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  31.15 
 
 
913 aa  303  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  33.71 
 
 
963 aa  299  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  32.25 
 
 
993 aa  299  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  36.33 
 
 
1024 aa  298  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  31.25 
 
 
1022 aa  293  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  38.13 
 
 
612 aa  288  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  32.92 
 
 
1014 aa  287  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  33.52 
 
 
965 aa  285  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  32.7 
 
 
990 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  30.45 
 
 
962 aa  280  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  32.19 
 
 
1030 aa  277  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  31.51 
 
 
965 aa  276  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  28.7 
 
 
1027 aa  274  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  31.67 
 
 
956 aa  274  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  30.52 
 
 
964 aa  272  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  38.67 
 
 
910 aa  273  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  41.02 
 
 
994 aa  271  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  30.28 
 
 
921 aa  270  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  33.01 
 
 
935 aa  270  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  33.43 
 
 
788 aa  269  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  37.24 
 
 
1003 aa  268  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  31.73 
 
 
1008 aa  268  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  38.63 
 
 
632 aa  268  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  32.54 
 
 
1010 aa  267  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  40.22 
 
 
453 aa  266  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  30.49 
 
 
981 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  30.45 
 
 
908 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  29.05 
 
 
1011 aa  258  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  31.47 
 
 
1054 aa  256  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  36.88 
 
 
926 aa  253  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 
850 aa  250  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  29.13 
 
 
930 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  28.96 
 
 
907 aa  246  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  29.35 
 
 
928 aa  244  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  32.34 
 
 
989 aa  244  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  35.51 
 
 
621 aa  243  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  33.99 
 
 
1001 aa  241  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  31.97 
 
 
937 aa  241  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  36.93 
 
 
582 aa  240  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  35.6 
 
 
1034 aa  239  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  32.52 
 
 
790 aa  237  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  36.98 
 
 
1033 aa  238  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  33.55 
 
 
792 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  29.95 
 
 
983 aa  236  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  34.7 
 
 
1003 aa  234  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  36.76 
 
 
915 aa  234  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  32.57 
 
 
666 aa  234  9e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 
995 aa  233  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  33.29 
 
 
910 aa  233  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  38.04 
 
 
496 aa  227  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  28.87 
 
 
967 aa  226  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 
755 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  31.09 
 
 
797 aa  224  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  32.66 
 
 
741 aa  220  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  27.88 
 
 
993 aa  214  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  34.05 
 
 
622 aa  213  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  35.55 
 
 
915 aa  213  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  31.94 
 
 
715 aa  209  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6871  hypothetical protein  30.86 
 
 
854 aa  208  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361895  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  32.99 
 
 
928 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  30.19 
 
 
941 aa  205  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  30.55 
 
 
1030 aa  205  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  30.18 
 
 
896 aa  202  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
814 aa  198  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  30.29 
 
 
978 aa  197  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30.06 
 
 
631 aa  196  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>