More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3097 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 915 aa  1737    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  52.07 
 
 		 926 aa  726    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  50.27 
 
 		 910 aa  714    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  47.1 
 
 		 910 aa  571  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  34.88 
 
 		 934 aa  365  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  35.75 
 
 		 981 aa  325  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  39.29 
 
 		 990 aa  299  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  35.56 
 
 		 935 aa  297  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  37.61 
 
 		 1108 aa  298  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  40.46 
 
 		 1030 aa  291  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.21 
 
 		 1022 aa  288  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  35.09 
 
 		 931 aa  288  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  32.58 
 
 		 1025 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  38.39 
 
 		 992 aa  284  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  37.84 
 
 		 990 aa  278  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 1071 aa  275  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  31.39 
 
 		 996 aa  272  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  38.21 
 
 		 1088 aa  266  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  39.9 
 
 		 1003 aa  261  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  41.45 
 
 		 954 aa  257  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  36.87 
 
 		 921 aa  257  8e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  37.35 
 
 		 971 aa  256  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  39.02 
 
 		 950 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  31.42 
 
 		 1022 aa  250  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  36.41 
 
 		 1010 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  35.75 
 
 		 962 aa  248  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  32.67 
 
 		 1025 aa  246  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 1346 aa  245  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  37.83 
 
 		 913 aa  244  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  36.52 
 
 		 1014 aa  243  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  35.38 
 
 		 940 aa  243  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 1319 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  32.24 
 
 		 1008 aa  240  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  31.3 
 
 		 928 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  36.2 
 
 		 995 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 654 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  36.21 
 
 		 1021 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  35.84 
 
 		 956 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  39.57 
 
 		 1024 aa  231  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.52 
 
 		 921 aa  230  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  35.99 
 
 		 963 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  31.13 
 
 		 907 aa  227  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  35.65 
 
 		 1013 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  32 
 
 		 1003 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  33.68 
 
 		 941 aa  226  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  35.14 
 
 		 964 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  33.87 
 
 		 981 aa  225  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  35.57 
 
 		 983 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  37.02 
 
 		 775 aa  222  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  32.33 
 
 		 1027 aa  220  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  33.29 
 
 		 946 aa  220  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  34.04 
 
 		 621 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  35.23 
 
 		 1003 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  31.5 
 
 		 992 aa  218  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  34.1 
 
 		 930 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 622 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  36.31 
 
 		 1034 aa  214  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.87 
 
 		 1017 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  33.29 
 
 		 967 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  32.17 
 
 		 1033 aa  210  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  33.89 
 
 		 965 aa  210  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  34.22 
 
 		 919 aa  207  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  32.9 
 
 		 978 aa  206  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  34.57 
 
 		 1138 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  32.86 
 
 		 970 aa  205  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  32.83 
 
 		 1030 aa  204  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  34.73 
 
 		 908 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  35.58 
 
 		 788 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  35.99 
 
 		 928 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  36.61 
 
 		 1001 aa  193  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  35.6 
 
 		 1054 aa  193  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 		 453 aa  191  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  35.18 
 
 		 612 aa  190  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.27 
 
 		 496 aa  187  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  31.68 
 
 		 810 aa  185  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  30.47 
 
 		 1020 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 1048 aa  181  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  35.18 
 
 		 632 aa  178  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  33.12 
 
 		 993 aa  178  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  35.32 
 
 		 994 aa  177  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 621 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  35.81 
 
 		 1000 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 602 aa  174  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  31.41 
 
 		 937 aa  174  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  33.8 
 
 		 790 aa  171  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  38.85 
 
 		 915 aa  170  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  33.04 
 
 		 982 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  34.28 
 
 		 597 aa  169  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  36.96 
 
 		 1093 aa  168  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 806 aa  167  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  31.38 
 
 		 957 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  30.37 
 
 		 965 aa  165  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  29.92 
 
 		 757 aa  163  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  36.6 
 
 		 715 aa  162  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  32.15 
 
 		 666 aa  160  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 850 aa  159  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37.92 
 
 		 1102 aa  158  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  38.36 
 
 		 978 aa  158  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.33 
 
 		 952 aa  157  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  29.27 
 
 		 631 aa  156  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>