More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3863 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 
981 aa  1961    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  39.04 
 
 
941 aa  492  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  38.96 
 
 
935 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  34.85 
 
 
934 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  36.6 
 
 
1008 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  34.86 
 
 
1022 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  36.2 
 
 
1020 aa  436  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  37.28 
 
 
931 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  33.74 
 
 
1108 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  36.07 
 
 
992 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  36.24 
 
 
1025 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  34.67 
 
 
964 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  35.5 
 
 
990 aa  419  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  35.86 
 
 
1071 aa  412  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  34.98 
 
 
1034 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  35.94 
 
 
996 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  33.69 
 
 
913 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  35.02 
 
 
1003 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  34.99 
 
 
1021 aa  396  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  33.99 
 
 
971 aa  379  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  34.56 
 
 
940 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  35.01 
 
 
1030 aa  376  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  34.02 
 
 
992 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  33.23 
 
 
1048 aa  373  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  32.72 
 
 
946 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  33.54 
 
 
962 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  33.44 
 
 
970 aa  365  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  32.23 
 
 
1014 aa  363  7.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.48 
 
 
1017 aa  362  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.29 
 
 
921 aa  358  3.9999999999999996e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  34.69 
 
 
954 aa  354  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  35.22 
 
 
1088 aa  352  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  32.36 
 
 
1010 aa  348  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  31.96 
 
 
1346 aa  344  5.999999999999999e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  33.23 
 
 
950 aa  337  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  35.26 
 
 
963 aa  336  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 
1013 aa  336  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  31.13 
 
 
1022 aa  332  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  34.09 
 
 
1003 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  40.45 
 
 
926 aa  332  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  34.61 
 
 
965 aa  331  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  38.78 
 
 
654 aa  330  8e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  39.14 
 
 
1025 aa  330  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  38.9 
 
 
1319 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  32.15 
 
 
990 aa  325  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  32.27 
 
 
1030 aa  320  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  32.02 
 
 
919 aa  320  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 
908 aa  320  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  38.41 
 
 
621 aa  317  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  35.47 
 
 
788 aa  317  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  37.97 
 
 
983 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  36.51 
 
 
995 aa  313  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  36.16 
 
 
1027 aa  313  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  31.22 
 
 
967 aa  313  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  30.99 
 
 
930 aa  313  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  31.23 
 
 
928 aa  311  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  32.11 
 
 
956 aa  310  9e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 
993 aa  307  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  31.13 
 
 
928 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  33.13 
 
 
775 aa  306  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  31.83 
 
 
907 aa  304  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  32.16 
 
 
921 aa  303  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  38.12 
 
 
1138 aa  299  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  34.15 
 
 
937 aa  298  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  35.75 
 
 
915 aa  295  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  33.48 
 
 
910 aa  295  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  34.27 
 
 
790 aa  294  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  32.64 
 
 
965 aa  293  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  32.03 
 
 
1054 aa  293  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  37.24 
 
 
1033 aa  292  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  34.42 
 
 
1001 aa  290  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.64 
 
 
989 aa  290  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  34.55 
 
 
910 aa  285  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  35.44 
 
 
1024 aa  285  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  34.24 
 
 
981 aa  283  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  36.81 
 
 
612 aa  280  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  30.88 
 
 
1011 aa  279  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  42.26 
 
 
453 aa  277  7e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  40.7 
 
 
496 aa  270  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  36.94 
 
 
792 aa  269  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  36.51 
 
 
632 aa  268  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  32.86 
 
 
797 aa  266  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  31.87 
 
 
783 aa  262  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  31.4 
 
 
1003 aa  256  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  29.19 
 
 
1033 aa  251  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  34.83 
 
 
666 aa  251  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  36.29 
 
 
622 aa  249  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  31.57 
 
 
978 aa  248  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
850 aa  244  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  33.83 
 
 
982 aa  241  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.81 
 
 
631 aa  240  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 
755 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  37.6 
 
 
994 aa  235  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 
775 aa  232  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5351  hypothetical protein  33.56 
 
 
862 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  31.59 
 
 
993 aa  230  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  32.87 
 
 
915 aa  225  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 
582 aa  223  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  36.55 
 
 
782 aa  219  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  32.6 
 
 
814 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.806714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>