More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3752 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 992 aa  1944    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  38.03 
 
 		 1003 aa  465  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  35.4 
 
 		 1022 aa  455  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  34.92 
 
 		 934 aa  415  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  35.93 
 
 		 1021 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  34.81 
 
 		 990 aa  409  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  32.89 
 
 		 1108 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.31 
 
 		 981 aa  386  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  36.05 
 
 		 1138 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  36.54 
 
 		 950 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  40.03 
 
 		 654 aa  378  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  30.96 
 
 		 996 aa  360  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  34.49 
 
 		 971 aa  360  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  33.96 
 
 		 954 aa  359  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.28 
 
 		 1025 aa  355  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  33.27 
 
 		 941 aa  351  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  34.14 
 
 		 1025 aa  350  9e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  32.61 
 
 		 913 aa  350  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  39.26 
 
 		 621 aa  347  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  33.57 
 
 		 1020 aa  346  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.23 
 
 		 1013 aa  344  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  34.83 
 
 		 935 aa  343  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  32.15 
 
 		 1022 aa  341  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  38.25 
 
 		 1024 aa  340  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  32.51 
 
 		 919 aa  339  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.3 
 
 		 1017 aa  339  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  34.15 
 
 		 940 aa  334  5e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.82 
 
 		 921 aa  334  6e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.57 
 
 		 964 aa  330  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  32.91 
 
 		 1088 aa  329  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  32.14 
 
 		 993 aa  329  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 963 aa  328  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  32.58 
 
 		 970 aa  325  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  32.88 
 
 		 921 aa  325  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  38.9 
 
 		 1319 aa  321  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 1346 aa  322  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 775 aa  319  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 1071 aa  318  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  32.84 
 
 		 931 aa  314  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  30.95 
 
 		 907 aa  313  7.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.94 
 
 		 962 aa  307  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  40.92 
 
 		 994 aa  306  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  36.54 
 
 		 1010 aa  306  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  31.98 
 
 		 992 aa  305  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  28.63 
 
 		 1027 aa  303  9e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  36.46 
 
 		 1014 aa  303  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  31.1 
 
 		 946 aa  300  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  33.68 
 
 		 965 aa  296  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  31.27 
 
 		 956 aa  296  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  35.51 
 
 		 1030 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  37.95 
 
 		 989 aa  295  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  36.33 
 
 		 1003 aa  294  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  35.36 
 
 		 1008 aa  292  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  33.49 
 
 		 995 aa  290  7e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  38.62 
 
 		 926 aa  290  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  35.59 
 
 		 990 aa  287  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  39.09 
 
 		 632 aa  286  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 1048 aa  281  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.24 
 
 		 983 aa  280  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  39.81 
 
 		 910 aa  280  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  30.1 
 
 		 930 aa  279  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  31.95 
 
 		 928 aa  276  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  35.72 
 
 		 788 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  30.7 
 
 		 965 aa  270  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  29.66 
 
 		 967 aa  268  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  37.46 
 
 		 910 aa  266  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 		 850 aa  265  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.18 
 
 		 496 aa  265  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  29.31 
 
 		 1011 aa  264  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  30.44 
 
 		 908 aa  264  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  31.2 
 
 		 928 aa  263  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  38.19 
 
 		 915 aa  263  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  30.37 
 
 		 1034 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 622 aa  257  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  28.78 
 
 		 981 aa  254  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  32.38 
 
 		 790 aa  254  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  34.07 
 
 		 666 aa  253  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  34.64 
 
 		 1030 aa  250  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  34.95 
 
 		 1003 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  34.6 
 
 		 612 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  39.56 
 
 		 453 aa  248  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  33.92 
 
 		 1033 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  31.05 
 
 		 937 aa  241  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.7 
 
 		 631 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  31.2 
 
 		 982 aa  234  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  35.04 
 
 		 1001 aa  233  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  35.13 
 
 		 582 aa  231  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  30.62 
 
 		 1054 aa  231  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  30.82 
 
 		 797 aa  229  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  28.67 
 
 		 993 aa  228  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  31.47 
 
 		 792 aa  228  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  34.05 
 
 		 715 aa  228  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 		 978 aa  226  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 621 aa  221  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  46.52 
 
 		 378 aa  220  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  29.31 
 
 		 1033 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  32.28 
 
 		 957 aa  212  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  32.01 
 
 		 810 aa  211  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  32.17 
 
 		 792 aa  210  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  42.28 
 
 		 960 aa  208  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>